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• W1208876886 abstract "Dans un contexte de recherche de solutions pour une agriculture a la fois productive et durable, les principes, theories et methodes de l’ecologie semblent offrir des pistes a explorer pour comprendre le fonctionnement biologique des agro-ecosystemes. Notre cas d’etude concernait les informations collectees par un reseau d’observatoires de la flore adventice a l’echelon national (‘Biovigilance Flore’) sur lequel nous avons recherche les regles sous jacentes a l’assemblage et la dynamique des communautes adventices au sein des parcelles de grandes cultures annuelles. Nous avons en particulier etudie les relations qui peuvent exister au sein des especes d’une meme communaute ainsi que celles affectant les relations des communautes a leur environnement. Pour tenir compte de son importance averee dans la constitution des assemblages, nous avons conduit notre etude en tenant compte de l’abondance de la population de chaque espece. Les principaux resultats issus des travaux realises au cours de cette these sont : Un assemblage non aleatoire des abondances et une structuration conduisent a une homogeneisation des abondances observees a l’echelle des parcelles. Selon la densite totale d’adventices sur une parcelle, on observe des structurations opposees selon qu’une espece domine, ou non, dans la communaute. Meme si la methodologie employee pour realiser les releves nous empeche d’en avoir la preuve, nous suspectons que l’abondance des adventices repond a la competition qui s’exerce dans certaines conditions directement entre especes adventices.Le choix du modele nul servant de base de comparaison dans les situations ou il n’y a pas de temoin joue un role important dans la conduite des analyses des observations issues d’inventaires. L’echelle semi-quantitative pour rendre compte des variations d’abondance pose probleme puisque aucun modele nul n’a ete developpe pour ce format particulier. Un modele adapte a notre situation, mais malgre tout generique, a ete developpe. Il apporte une amelioration sensible par rapport a l’existant pour etudier le degre de co occurrence (ainsi que la dispersion de traits) dans le cas de donnees semi-quantitatives. Ceci a des consequences sur notre capacite a distinguer les facteurs ayant un role de filtre sur la flore potentielle qui s’exprime. La modelisation de la dynamique d’une espece au sein d’une parcelle au fil des successions culturales necessite de rendre compte de la dynamique du stock de graines dans le sol. Inconnu, ce stock de graines a ete considere comme une variable cachee, modelisable par l’utilisation d’un modele de Markov cache. Cette approche s’est trouvee etre remarquablement adaptee a la biologie des especes annuelles. Nous avons ainsi pu apprehender l’effet des pratiques culturales sur la dynamique du stock de graines et de la flore levee. Cette etude a des retombees tant sur l’identification des traits d’histoire de vie que sur leur variabilite face a des strategies de gestion qui seraient deployees pour assurer le controle d’une flore specifique. Nous avons ainsi pu appliquer avec succes quelques principes theoriques et ameliorer les methodes d’analyse afin de tenir compte des specificites des especes adventices, de l’amplitude des fluctuations du milieu dans lequel elles evoluent et des specificites de nos donnees. Il existe une marge de progres sur la collecte des donnees a realiser sur les reseaux d’observatoires si l’on veut maitriser la connaissance des leviers les plus a meme d’aider au controle de la flore adventice" @default.
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