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• W1479807229 abstract "The actin gene of tardigrades was sequenced and analysed using a λ ZAP Express cDNA library from the eutardigrade Hypsibius klebelsbergi previously constructed by us. We obtained the complete actin coding sequence of one isoform (1128 bp; 375 amino acids; MW 41 674 Da) together with parts of the 3′- and 5′- UTR region. Comparison of the 12 incomplete actin sequences of Hypsibius dujardini incorporated in GenBank indicates that this H. klebelsbergi actin sequence probably represents the most abundant muscle isoform. Ten of the H. dujardini clones show minor differences in codon usage and identical amino acid compositions to the H. klebelsbergi actin. Only two clones show amino acid variations in one and five positions, respectively, but show identical amino acids at their N-terminus. A considerable similarity between the 5′- and 3′-UTR regions of both tardigrade species was recognized. The H. klebelsbergi actin exhibits an overall high sequence similarity to the vertebrate β-actin. A comparison of muscle actins from various vertebrates as well as Ecdysozoa and non-Ecdysozoa revealed a more pronounced similarity of the tardigrade actin to arthropods and annelids and not to nematodes. Ein Aktin-Gen aus Tardigraden wurde mit Hilfe einer kürzlich von uns konstruierten λ ZAP Express cDNA Bibliothek des Eutardigraden Hypsibius klebelsbergi analysiert und sequenziert. Wir stellen die gesamte Aktin kodierende Sequenz einer Isoform (1128 bp; 375 Aminosäuren; MW 41.674 Da) sowie Teile der 3′-and 5′-UTR Regionen vor. Ein Vergleich der zwölf Fragmente mit den unvollständigen Aktin Sequenzen von Hypsibius dujardini (aus GenBank) lässt vermuten, dass die Sequenz von H. klebelsbergi die häufigste Isoform und damit wohl eine Muskelisoform repräsentiert. Zehn der H. dujardini-Klone zeigten geringfügige Unterschiede im Codon-Gebrauch und eine mit dem Aktin von H. klebelsbergi identische Zusammensetzung von Aminosäuren. Bei zwei Klonen traten Variationen in der Aminosäurenzusammensetzung in einer bzw. in fünf Positionen auf, die Aminosäuren am N26 Terminus waren jedoch identisch. Die Ähnlichkeiten zwischen den 5′- and 3′-UTR Regionen beider Arten war beträchtlich. Die Sequenz des H. klebelsbergi-Aktins entspricht weitgehend dem β-Aktin der Wirbeltiere. Ein Vergleich mit Muskel-Aktinen verschiedener Wirbeltiere sowie Ecdysozoa und Nicht-Ecdysozoa zeigt eine größere Ähnlichkeit des Tardigraden-Aktins mit Aktinen von Arthropoden und Anneliden, nicht aber mit Nematoden-Aktinen. Figure S1. Full-length coding region and derived amino acid sequence of the actin isoform predominantly present in the cDNA library of Hypsibius klebelsbergi. The coding region is in capital letters, whereas small letters represent the 5′-UTR and the 3′-UTR regions. The deduced amino acid sequence is given in the one-letter code. ATG = start codon; TAG = stop codon. Table S1. PCR-primers used; I = inositol; Y = CT; R = AG. Please note: The publisher is not responsible for the content or functionality of any supporting information supplied by the authors. Any queries (other than missing content) should be directed to the corresponding author for the article." @default.
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