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• W1487777488 abstract "Deux especes sauvages de tournesols Helianthus annuus et H. petiolaris ont donne naissance il y a plusieurs milliers d'annees a une espece hybride H. paradoxus infeodee a des marais salins. Ma these a consiste a caracteriser les bases genetiques de l'adaptation de H. paradoxus a ce milieu extreme. J'ai recherche des signatures de selection a deux echelles : a l'echelle du genome et a une echelle plus fine comprise entre 20 et 90 cM. Pour cela j'ai analyse les patrons de diversite genetique pour des marqueurs microsatellites dans trois populations naturelles de H. paradoxus et des deux especes parentales, autour de trois QTL de survie et ailleurs dans le genome. A l'echelle du genome, une baisse de diversite autour de ces QTL a ete mise en evidence chez l'espece hybride et non chez ses parents indiquant qu'il est possible de detecter une signature de la selection a cette echelle chez cette espece. A l'echelle plus fine, le patron de diversite est en mosaique. L'ordre des marqueurs n'etant pas connu avec certitude chez l'espece hybride, une methode basee sur le desequilibre de liaison entre des marqueurs genotypes dans des populations naturelles a ete developpee. Cette methode permet de regrouper sur une carte des marqueurs en fort desequilibre de liaison. La correspondance entre carte de desequilibre de liaison et carte genetique varie selon les populations et l'echelle genetique. Parallelement une etude physiologique et d'expression genique visant a comprendre le mecanisme d'adaptation a la salinite de H. paradoxus a ete conduite. L'espece hybride est tres plastique, mais se porte mieux en milieu salin, ses feuilles sont plus succulentes, avec une concentration en sodium et sulfate tres elevee dans ses tissus. Plusieurs genes candidats, impliques dans differentes voies de reponse a la salinite, et dont certains sont cartographies dans les regions des QTL, sont differentiellement exprimes chez l'espece hybride et chez ses parents. Ces resultats confirment qu'ils sont des candidats potentiels importants dans l'adaptation de H. paradoxus aux marais salins et donc impliques dans le processus de speciation." @default.
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