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- W1490062255 abstract "随机的上下文无关文法(SCFG ) 被用于预言 RNA 第二等的结构。RNA 第二等的结构的预言能被与比较顺序分析合并便于。然而，大多数存在基于 SCFG 的方法缺乏相应 RNA 序列的明确的系统发生的分析，它可能是这些方法不在实际申请是理想的原因。因此，我们在场由与最新定义的侧面 SCFG 集成系统发生的分析的一个新基于 SCFG 的方法。方法能是被总结：1 ) 我们定义新侧面 SCFG， M，描绘一致多重 RNA 的第二等的结构顺序对准；2 ) 我们介绍二不同隐藏的 Markov， λ 和 λ′ ，执行相应 RNA 序列的系统发生的分析。这里， λ 为顺序和 λ′ 的非结构的区域为顺序的结构的区域；3 ) 我们合并 λ 和 λ′进 M 到为 RNA 的预言设计一个联合模型第二等的结构。我们在从 Rfam 数据库构造的数据集合上测试了我们的方法。我们的方法的敏感和特性是比由 Pfold 的预言的那些更精确的。这篇文章(doi:10.1007/s11390-008-9154-7 ) 的联机版本包含增补材料，它对授权用户可得到。" @default.
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