FRINK Linked Data Fragments server

Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W1504832263> ?p ?o ?g. }

• W1504832263 abstract "Mollusken (o.a. slakken) maken deel uit van de enorm grote groep vaninvertebraten. De vroege ontwikkeling van de mollusk Patella vulgata is bestudeerdals modelsysteem voor de mollusken. De vroege ontwikkeling van deze zeeslakkenkenmerkt zich door enerzijds de manier van klieven, namelijk spiraalklieving, enanderzijds door de vorming van een larvaal stadium, de trochophora larve. Detrochophora beweegt zich voort met behulp van een gecilieerde band met cellen,genaamd de prototrooch. De eerste cellen worden al zeer vroeg in de ontwikkelinggevormd tijdens de vierde klieving waardoor een 16-cellig embryo ontstaat. Vier cellenzullen differentieren (zich ontwikkelen) tot primaire trochoblasten, die nog twee maaldelen en daarna cilien gaan vormen. In dit onderzoek is gekeken naar hoe deze cellenweten dat ze trochoblastcel zijn, met name welke factoren hiervoor bepalend zijn.Al sinds 1900 wordt gedacht dat deze factoren door de moederslak in de eicelworden geplaatst, vandaar de naam maternele factoren, en door de delingen specifiekin de trochoblast cellen terecht komen. Dit proces hebben wij op een moleculair niveaubestudeerd. De trochoblast cellen brengen als enige cellen vanaf het 32-cellig stadiumeen tubuline gen tot expressie, wat leidt tot de aanmaak van tubuline eiwit dat nodig isvoor de cilien. De regulatie van dit tubuline gen is bestudeerd op het niveau vantranscriptie, het overschrijven van het DNA op het chromosoom wat leidt tot deaanmaak van een boodschapper molecuul (mRNA) dat later vertaald wordt in eeneiwit. Verschillende factoren zijn noodzakelijk voor deze transcriptionele regulatie,namelijk specifieke stukken in het gen, de ‘cis-acting’ elementen, en ‘trans-acting’factoren die daar aan kunnen binden, ook transcriptiefactoren genaamd. Voor deregulatie van het tubuline gen zijn twee cis-acting elementen onmisbaar, e e n elementwaar een remmende factor aan kan binden en e e n element waaraan een activerendefactor bindt. In hoofdstuk 3 zijn de resultaten van de zoektocht naar de ‘trans-acting’factoren die aan deze ‘cis-acting’ elementen binden beschreven. Met een‘Southwestern assay’, waarin de binding van eiwitten aan stukjes DNA kan wordenbestudeerd, is vastgesteld dat de activerende factor waarschijnlijk een klein eiwitje meteen molecuulgewicht dat kleiner is dan 20 kDalton. Andere eiwitten die ook aan debelangrijkste ‘cis-acting’ elementen binden met molecuulgewichten van 42 and 55kDalton werden tevens gevonden. Verder tonen ‘gel shift’ experimenten aan dat erverschillende factoren binden aan de belangrijkste ‘cis-acting’ elementen opverschillende tijdstippen van de ontwikkeling van de larve, wat zou kunnen betekenendat er verschillende factoren nodig zijn voor het aanschakelen van het tubuline gentijdens de vroege ontwikkeling en voor het onderhoud van de tubuline expressie later. We hebben geprobeerd om deze factoren met verschillende methoden uit embryos tezuiveren, maar dat is niet gelukt. Met behulp van ‘Cytochalasine B’ experimenten isverder bepaald dat de factoren nodig voor tubuline expressie in de trochoblast cellen alaanwezig zijn in de moedercellen van de trochoblasten op het 8-cellig stadium, demicromeren, en niet in de overige cellen, de macromeren. Tevens is de correctevorming van de micromeren en de macromeren tijdens de derde klieving, namelijk devorming van een animale laag (aan de ‘bovenkant’) van vier micromeren bovenop viermacromeren aan de vegetatieve kant (‘onderkant’) van het embryo, noodzakelijk voorcorrecte tubuline expressie (hoofdstuk 2).Een tweede strategie om de maternele factoren die door de moederslak in hetembryo geplaatst worden en die van belang zijn voor het bepalen van de identiteit vaneen cel, te isoleren was de uitvoering van een ‘differential display’. Er is gekeken naarverschillen in boodschapper moleculen (mRNA’s) tussen de micromeren enmacromeren, die coderen voor factoren die de ontwikkeling gaan bepalen. Dit heeft deisolatie van drie interessante eiwitten opgeleverd. Het eerste is glutaredoxin (mi9), eeneiwitje dat andere eiwitten kan modificeren door een redox reactie, een chemischereactie door uitwisseling van zuurstof atomen (hoofdstuk 5). Dit eiwitje kan mogelijktranscriptiefactoren die de ontwikkeling van een cel bepalen modificeren en alszodanig de ontwikkeling van bepaalde cellen beinvloeden. Verder is eentranscriptiefactor geisoleerd, mi10, die de transcriptie van verschillende genen kanreguleren (hoofdstuk 6). Tenslotte Esther32 (E32), een RNA-bindend eiwit, wat deaanmaak van bepaalde eiwitten kan beinvloeden (hoofdstuk 7). Het mRNA voor diteiwit komt specifiek in bepaalde cellen voor, die gekenmerkt worden door het feit datze nog delen. Niet delende cellen die al gedifferentieerd zijn, zoals de trochoblasten inde prototrooch hebben E32 mRNA niet. Dit suggereert dat E32 een rol speelt bij hetbepalen wanneer een cel stopt met delen en gaat differentieren. De precieze rol vandeze eiwitten tijdens de vroege ontwikkeling van Patella vulgata moet verderonderzocht worden.Verder is er gekeken of het mechanisme dat de trochoblasten in Patella embryosgebruiken voor hun differentiatie ook voor komt bij andere diersoorten die ook eenspiraalklieving hebben (hoofdstuk 4). Eerst is gekeken naar andere slakken (van hetfylum Mollusca), namelijk de soorten Dentalium en Acantochiton. Deze slakkenbrengen het tubuline gen van Patella ook specifiek in de trochoblast cellen totexpressie, waaruit kan worden afgeleid dat de factoren nodig voor de expressie van hettubuline gen aanwezig zijn in deze slakken en dat deze slakken waarschijnlijkhetzelfde mechanisme gebruiken voor de expressie van hun eigen tubuline in detrochoblast cellen. Dit zou betekenen dat dit mechanisme voor trochoblast specifieketubuline expressie evolutionair geconserveerd is in de mollusken en daarom alwaarschijnlijk aanwezig was in de voorouder van de slakken. Er is ook gekeken naarandere soorten, namelijk de ‘polychaete’ ringwormen Platynereis, Nereis enChaetopterus (fylum Annelida), de ‘ribbon’ worm Cerebratulus en de platwormHoploplana. Van deze wormen brachten e e n embryo van de ringworm Platynereis en meerdere embryos van de ‘ribbon’worm Cerebratulus het Patella tubuline totexpressie. Omdat in de laatste embryos het tubuline gen niet specifiek in detrochoblasten tot expressie werd gebracht, is het nog niet geheel duidelijk of hetmechanisme voor trochoblast specifieke tubuline expressie ook buiten het fylumMollusca geconserveerd is.De experimenten beschreven in dit proefschrift geven aanleiding tot nadenkenover de manier waarop cellen tijdens de vroege embryogenese van de mollusc Patellavulgata gespecificeerd worden. Ondanks dat er sterke aanwijzingen zijn dat detrochoblasten gespecificeerd worden door de aanwezigheid van gelocaliseerdematernele factoren, is het niet gelukt om differentieel gedistribueerde factoren teisoleren. In tegenstelling tot de differentiele distributie van mRNA’s die coderen voorfactoren betrokken bij determinatieprocessen in andere soorten zoals de fruitvliegDrosophila, zijn er in Patella geen differentieel gedistribueerde mRNA’s gevonden ophet 8-cellig stadium. Wel zijn er aanwijzingen gevonden dat door middel vanmechanismen op het niveau van de vertalen van mRNA’s (translatie) eneiwitmodificatie (post-translationele modificatie) een differentiele activiteit vandeterminerende factoren verkregen kan worden. Esther 32 is een RNA-bindend eiwiten zou de translatie van bepaalde voor specificatie belangrijke mRNA’s kunnenbeinvloeden. Glutaredoxin kan eiwitten, waaronder mogelijk transcriptiefactoren, post-translationeelmodificeren en de activiteit van mi10, een transcriptiefactor, wordtmogelijk gereguleerd door fosforylatie." @default.
• W1504832263 created "2016-06-24" @default.
• W1504832263 creator A5063391368 @default.
• W1504832263 date "2001-01-24" @default.
• W1504832263 modified "2023-09-27" @default.
• W1504832263 title "Molecular analysis of early specification in the mollusc Patella vulgata" @default.
• W1504832263 hasPublicationYear "2001" @default.
• W1504832263 type Work @default.
• W1504832263 sameAs 1504832263 @default.
• W1504832263 citedByCount "0" @default.
• W1504832263 crossrefType "dissertation" @default.
• W1504832263 hasAuthorship W1504832263A5063391368 @default.
• W1504832263 hasConcept C127413603 @default.
• W1504832263 hasConcept C505870484 @default.
• W1504832263 hasConcept C86803240 @default.
• W1504832263 hasConceptScore W1504832263C127413603 @default.
• W1504832263 hasConceptScore W1504832263C505870484 @default.
• W1504832263 hasConceptScore W1504832263C86803240 @default.
• W1504832263 hasLocation W15048322631 @default.
• W1504832263 hasOpenAccess W1504832263 @default.
• W1504832263 hasPrimaryLocation W15048322631 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1483181893 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1484116899 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1546891974 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1552951197 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1598486605 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1701117670 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2095953538 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2096885309 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2127017467 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2310966220 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2329236233 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2332245987 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2481570345 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2568757326 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2576849078 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2757719756 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W589175851 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W72836561 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W1954302083 @default.
• W1504832263 hasRelatedWork W2147968628 @default.
• W1504832263 isParatext "false" @default.
• W1504832263 isRetracted "false" @default.
• W1504832263 magId "1504832263" @default.
• W1504832263 workType "dissertation" @default.