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• W15561145 abstract "L'etude de l'evolution des genomes peut etre abordee par differentes strategies. Generalement, les analyses reposent sur les polymorphismes de sequences. Cependant, il existe des genomes dont le taux de mutation est tres faible et dont la principale source de polymorphisme provient de l'arrangement different de leurs genes le long des chromosomes. Les evenements de rearrangements chromosomiques deviennent alors les seuls marqueurs utilisables pour retracer l'evolution de ces genomes. Nous nous sommes interesses dans ce travail a l'analyse de l'evolution des genomes mitochondriaux d'especes vegetales au niveau de leur structure. En effet, ces genomes sont caracterises par un faible taux de mutation et un taux eleve de rearrangements. Cette etude s'est portee a un niveau intraspecifique afin de limiter le nombre de rearrangements a analyser et sur deux especes : Zea mays, le mais, et Beta vulgaris, la betterave. Il s'avere, qu'en plus du polymorphisme de structure, ces genomes contiennent un grand nombre d'elements dupliques. Or les outils d'analyse d'evenements de rearrangements ne permettent pas d'inclure les evenements de duplication autrement qu'en distinguant les paralogues des orthologues, ce qu'il est particulierement difficile a realiser ici, du fait que les dupliques sont identiques en sequence. Nous avons ici etabli une strategie basee sur l'hypothese que les elements dupliques proviennent de duplications en tandem, permettant la reconnaissance, le tri et la distinction des elements dupliques. Cette methode nous a conduits a proposer une histoire evolutive basee sur des rearrangements congruente avec les phylogenies de sequences. Les comparaisons entre genomes mitochondriaux de mais et betteraves nous ont permis de montrer que des mecanismes evolutifs differents sont a l'origine de la diversite genomique observee. Nous avons egalement observe des differences evolutives entre les genomes a un niveau intraspecifique soulevant le probleme d'echantillonnage lorsque l'on veut comparer des genomes a un niveau interspecifique." @default.
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