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- W1567437305 abstract "Deux types de problematiques differentes peuvent motiver l'approche structurale d'une macromolecule. Soit la fonction de cette macromolecule est inconnue et l'on determine sa structure afin de mieux connaitre sa fonction ; cette demarche etait l'un des defis du developpement de la genomique structurale. Soit la fonction est connue et la structure va permettre de comprendre comment cette molecule remplit son role biologique. Durant ma these, j'ai eu l'occasion de pouvoir aborder deux projets structuraux tres differents, qui correspondent a ces deux approches de biologie structurale. C'est pourquoi mon manuscrit decrit ces deux projets dont la demarche scientifique est differente et complementaire pour ma formation en biologie structurale. Dans un premier temps, je decrirai les resultats obtenus sur le projet PAB0955, debute en stage de DEA et poursuivi pendant les deux premieres annees de ma these. Ce projet avait pour objectif de determiner la fonction de la proteine d'apres sa structure. La proteine PAB0955 est de fonction biologique inconnue, elle hydrolyse le GTP et elle n'a pas de proche homologue dont la structure est connue. La demarche scientifique de ce projet a ete de determiner la structure de cette proteine, puis d'analyser sa structure en la comparant de maniere systematique a l'ensemble des proteines ATPases et GTPases. Notre etude a ete conduite dans l'objectif extraire un maximum d'information fonctionnelle a partir des donnees structurales. Dans une deuxieme partie, je decrirai notre etude sur des proteines du systeme immunitaire humain debute en troisieme annee de these. Nous nous sommes interesses a des molecules impliquees dans la reconnaissance d'antigene : le recepteur du lymphocyte T (TCR) et la molecule du complexe majeur d'histocompatibilite (CMH). L'objectif de ce projet est de comprendre comment un complexe antigene-CMH selectionne un repertoire de lymphocyte T specifique. L'objectif etant de determiner le lien entre les caracteristiques structurales d'un complexe antigene-CMH et la diversite et la frequence des lymphocytes T actives par ce complexe. En resume correler les observations structurales avec les donnees immunologiques dont nous disposons. En determinant les bases structurales du caractere antigenique d'un peptide presente par une molecule CMH nous pourrons, a plus long terme, produire des peptides efficaces dans le cadre d'une vaccination" @default.
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