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• W16139437 abstract "Le modele Aevol est un modele d'evolution experimentale in silico developpe par Carole Knibbe et Guillaume Beslon pour etudier l'evolution de la structure des genomes. Aevol a permis d'identifier une tres forte pression de selection indirecte vers un certain niveau de variabilite mutationnelle du phenotype : la survie a long terme d'une lignee etant conditionnee a sa capacite a produire des mutations avantageuses sans pour autant produire trop de mutations deleteres, un certain compromis entre robustesse et evolvabilite est indirectement selectionne. Une consequence de cette pression de selection indirecte est le role central joue par le taux spontane de rearrangements chromosomiques dans la determination de la structure du genome. Dans ce travail, nous avons modifie le modele Aevol pour introduire d'une part un processus explicite de regulation de l'expression des genes et d'autre part, une sensibilite aux similarites entre sequences dans les evenements de recombinaison de l'ADN. Nous avons ainsi pu etudier l'effet de ces variations sur la selection de second-ordre. Nous avons en particulier observe que celle-ci est extremement robuste aux choix de modelisation : les effets lies aux rearrangements sont en effet observes de la meme facon lorsque les organismes possedent un reseau de regulation (qui plus est, ces effets sont visibles sur le reseau lui-meme), lorsque les rearrangements se produisent preferentiellement entre sequences similaires et lorsque les transferts horizontaux sont possibles. De plus, les effets de cette pression de selection de second-ordre ne sont pas limites au niveau genomique : de forts taux de rearrangements tendent a donner lieu a des genomes presentant beaucoup d'operons, tres peu d'ARNs non-codants et des reseaux de regulation tres simples. Au contraire, chez les organismes ayant evolue avec de faibles taux de rearrangement, la plupart des genes sont transcrits sur des ARNs monocistroniques. Ces organismes possedent un grand nombre d'ARNs non-codants et presentent des reseaux de regulation tres complexes. Ces effets observes dans le modele a differents niveaux d'organisation peuvent s'apparenter a de nombreuses caracteristiques observees chez les organismes reels. Ainsi les pressions selectives indirectes observees grâce au model Aevol permettent de reproduire un large spectre de proprietes biologiques connues en ne modifiant que le seul taux de rearrangements dans le modele. Ces mecanismes de selection indirecte apparaissent donc comme de bons candidats pour expliquer ces memes observations sur les organismes reels." @default.
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