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- W175048268 abstract "Die vorliegende Arbeit liefert neue methodische Beitraege zur Untersuchung derStruktur und Dynamik von Biomolekuelen in Loesung mittels Voronoi-Analyse von Computersimulationen.Dabei werden sowohl kollektive wie auch Einteilchen-Eigenschaften der Solvathuellen und des Bulk-Mediumsbetrachtet.Als Modellproteine dienen Ubiquitin (PDB-code: 1UBQ), Calbindin (1CLB) und eine Phospholipase (2PLD)deren Solvatation in Wasser einen wesentlichen Bestandteil dieser Arbeit darstellt. Darueber hinaus werden Vorstudienzu Molekularen Ionischen Fluessigkeiten (MIL) angestellt die in den letzten Jahren unter anderem als umweltvertraegliche polare Loesungsmittel in den Vordergrund getreten sind. Trifluoroazetat-, Tetrafluoroborat- und Trifluoromethylsulfonat- Salze von alkyliertem Imidazolium werden einerseits in Reinform, andererseits in Mischung mitWasser untersucht.Neu an dieser Arbeit ist zunaechst die Atom-aufgeloeste Tesselierung, die fuer Systeme mit 30000 Atomenmit periodischen Randbedingungen ueber hundertausende Zeitschritte sehr rechenintensiv, und dahernur durch die effiziente Implementierung geeigneter Algorithmen zu bewerkstelligen ist.Auf dieser Grundlage werden weitestgehend parameterfreie Ansaetze zur lokalen und globalen Strukturanalyse entwickeltdie einerseits mit konventionellen Methoden wie etwa Radialen Verteilungsfunktionen und Orientierungskorrelationsfunktionenverglichen werden, andererseits zusaetzliche Moeglichkeiten der Interpretation bieten.Position und Orientierung von benachbarten Molekuelen kann direkt anhand von graphentheoretischen Interaktionen beschriebenund interpretiert werden. Ein Markov-Modell fuer die Dynamik innerhalb und zwischen einzelnen Solvathuellen wird entwickeltund auf MIL Systeme angewendet." @default.
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