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- W199596578 abstract "L'annotation genomique identifie l'ensemble des elements significatifs presents sur l'ADN genomique, le support du programme de fonctionnement de l'organisme. Elle predit leurs fonctions biologiques et leurs relations. L'annotation d'un genome complet est soumise a diverses contraintes: elle doit etre realisee rapidement et representer l'organisme comme systeme biologique fonctionnel coherent. Nous proposons une methode de verification de la qualite de l'annotation genomique, basee sur un ensemble de regles de coherence definies d'apres les connaissances et contraintes biologiques admises par la communaute scientifique. Ces regles verifient la completude de l'annotation (presence des elements vitaux pour l'organisme) et son absence d'erreur (sens biologique correct des elements decrits). Notre methode est appliquee dans le cadre du projet Genolevures, un projet de genomique comparee chez les levures hemiascomycetes. Nous avons mis en place un systeme d'annotation facilitant le travail d'annotation manuelle par les experts. L'integration de nos regles dans ce systeme permet de garantir la bonne qualite de l'annotation produite. Nous avons choisi de valider experimentalement l'application de ces regles en etudiant les interactions proteine-proteine chez les levures Saccharomyces cerevisiae et Yarrowia lipolytica par la technique de l'electrophorese en gel de polyacrylamide en bleu natif et SDS (BN/SDS PAGE). Les resultats obtenus apportent de nouvelles connaissances chez les levures etudiees. Ils demontrent l'universalite de certaines regles et le bien fonde de la strategie d'annotation." @default.
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