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• W2000396056 abstract "We consider the problem of statistically evaluating the similarity of DNA intronic regions of genes. Present algorithms are based on matching a sequence of interest with known DNA sequences in a gene bank and are designed primarily to assess homology among exonic regions of genes. Most research focuses on exonic regions because they have a clear biological significance, coding for proteins, and therefore tend to be more conserved in evolution than intronic regions. To investigate whether the intronic features of genes whose expression is highly sensitive to environmental perturbations differ from genes that have a more constant expression, a collection of oncogenes, tumor suppressor genes, and nonregulatory genes involved in energy metabolism are compared. An analysis of the features of these genes' intronic regions result in clustering by regulatory group. In addition, Billingsley's test for Markov structure (1961) suggests that 67% of the intronic regions in this collection of genes show evidence of nonrandom structure, indicating the possibility of a biological function for these regions. The result of Billingsley's test for homology is used as input to a clustering algorithm. The biological significance of this methodology lies in the identification of groups based on the intronic regions from genes of unknown function. With the advent of rapid sequencing techniques, there is a great need for statistical techniques to help identify the purpose of poorly understood portions of genes. These methods can be utilized to assess the functional group to which such a gene might possibly belong. Nous considérons le problème d'évaluer statistiquement la similarité entre des régions introniques de gènes dans l'ADN. Les algorithmes actuels sont fondés sur l'association d'une séqunce d'intérět avec des séquences d'ADN connues dans une banque de gènes, et sont conçus premièrement pour évaluer l'homologie entre les régions exoniques de gènes. La plus grande part de la recherche se concentre sur les regions exoniques parce qu'elles ont une importance biologique claire, codant pour les protéines, et, de par ce fait, ont tendance à ětre plus conservées dans l'évolution que les régions introniques. Afin de déterminer si les caractéristiques introniques des gènes dont l'expression est hautement sensible aux perturbations de l'environnement different des gènes qui ont une expression plus constante, une collection d'oncogènes, de gènes supprimeurs de tumeurs, et'enes non-régulatoires impliqués dans le métabolisme de l'énergie sont comparés. Une analyse des traits des régions introniques de ces génes a pour résultat le regroupement par groupe régulatoire. De plus, le test de Billingsley pour la structure de Markov (1961) suggère que 67% des régions introniques de cette collection de gènes démontre une évidence de structure nonaléatoire, indicant la possibilité d'une fonction biologique pources régions. Le résultat du test d'homologie de Billingsley est utilisé comme intrant dans un algorithme de regroupement. L'importance biologique de cette méthodologie repose sur l'identification de grupes fondés sur les régions introniques de gènes de fonctions inconnues. Avec l'avènement de techniques de mise en sequence rapide, il y a un grand besoin de techniques statistiques afin d'aider à identifier le rǒle de portions de gènes. Ces méthodes peuvent ětre utilisées afin d'évaluer le groupe fonctionnel auquel tel géne peut possiblement appartenir." @default.
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