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• W2056226641 abstract "Les rotavirus sont répandus dans l'ensemble du règne animal et sont responsables chez l'homme de la majorité des gastro-entérites aiguës du nourrisson. Leur génome comporte 11 segments d'ARN bicaténaire correspondant à 11 gènes. Les techniques de biologie moléculaire appliquées à l'épidémiologie des rotavirus sont l'électrophorèse des segments génomiques en gel de polyacrylamide (électrophorétypes), l'hybridation moléculaire, le génotypage par RT-PCR et l'analyse des séquences de gènes. Ces techniques ont permis de dégager les grandes propriétés épidémiologiques des rotavirus, et, en premier lieu, leur grande variabilité génétique. Les marqueurs épidémiologiques les plus étudiés sont les gènes codant pour les protéines antigéniques de capside VP4, VP6 et VP7, ainsi que le gène de la protéine non structurale NSP4. Les techniques de RT-PCR sont utilisées pour classer les souches circulantes en fonction des gènes des protéines VP4 et VP7 qui définissent les types P et G. Cette classification a conduit à l'élaboration d'un vaccin spécifiquement dirigé contre les types majoritaires. L'analyse des électrophorétypes et surtout l'étude des séquences nucléotidiques ont montré que les différents gènes d'un même virus peuvent être phylogénétiquement reliés à des groupes de gènes différents. De tels virus « mosaïques å démontrent l'importance du mécanisme de réassortiment génétique dans l'évolution des rotavirus. En revanche, l'étude des gènes potentiellement impliqués dans la virulence (VP4, NSP4) n'a pas permis pour le moment de définir des allèles spécifiquement associés au pouvoir pathogène. Rotaviruses are the major cause of acute gastroenteritis in infants and young animals. The rotavirus genome has 11 gene segments of dsRNA. The techniques of molecular biology applied to the study of rotavirus epidemics are polyacrylamide electrophoresis of dsRNA gene segments (electropherotyping), molecular hybridization, RT-PCR genotyping and nucleotide sequencing of the genes. These techniques have allowed to define the main epidemiological properties of rotaviruses, and, in the first place, their genetic variability. Epidemiological markers most commonly used involve genes encoding the viral capsid proteins (VP4, VP6 and VP7), as well as the non structural protein NSP4 gene. RT-PCR is used to classify viral strains according to VP4 and VP7 genes, which respectively define P and G types. This classification has led to the development of a rotavirus vaccine specifically targeted to the most widespread types. Electropherotyping and nucleotide sequencing demonstrated that the genes of a same virus could be phylogenetically related to different groups of genes. These viruses with gene mosaics clearly demonstrate the implication of gene reassortment in the evolution of rotaviruses. On the other hand, a link between pathogenesis and specific alleles of the genes potentially implied in the virulence (VP4, NSP4) has not yet been evidenced." @default.
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