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- W2595753755 abstract "O uso de sequencias de DNA tem sido a base da genomica comparativa paraestudos evolucionarios e a transferencia de informacoes de especies modelo paraespecies agricolas tem revolucionado a genetica molecular e estrategias demelhoramento das culturas. A combinacao de metodos classicos de genetica emelhoramento com tecnologias moleculares de analise genomica abre uma novaperspectiva para a ampliacao do conhecimento das bases geneticas e aceleracao deprogramas de melhoramento. A bioinformatica esta se tornando em uma ferramentaque sera parte essencial na pesquisa cientifica de plantas e que podera contribuirmuito para este desafio, permitindo fazer inferencias de funcao, estrutura e evolucaode genes e genomas, busca de marcadores, desenho de primers, entre outraspossibilidades. Neste sentido, tres estudos de genomica comparativa em gramineasforam realizados, utilizando a bioinformatica como ferramenta. No primeiro trabalho,o objetivo do trabalho foi analisar a abundância de microssatelites no genoma de 13especies do genero Oryza obtidas do GeneBank do National Center forBiotechnology Information NCBI, com programa SSRLocator, descrevendo astaxas, frequencias e padrao de distribuicao dos diferentes microssatelites. Afrequencia de microssatelites varia inversamente proporcional ao tamanho dogenoma da especie no genero Oryza. As especies de genoma A apresentam asmaiores frequencias para todos os tipos de microssatelites e totais no genero Oryza.Os trimeros compostos por citosinas e guaninas apresentam o maior percentual deocorrencia entre as especies de genero Oryza, sem relacao direta com o conteudoGC da especie. No segundo trabalho, a regiao promotora de 1000 pares de basesdos genes OsNramp de Oryza sativa subsp japonica cv. Nipponbare foi investigadaquanto a abundância de elementos cis-acting. As sequencias foram analisadasutilizando o programa Signal Scan Search do portal Plant Cis-acting RegulatoryDNA Elements (PLACE) para a identificacao dos diferentes elementos cis-actingpresentes em cada uma das regioes promotoras. Foram detectados 170 diferenteselementos cis-acting na regiao promotora dos genes membros da familia OsNramp,sendo um total de 14 elementos comuns a regiao promotora dos oito membros dafamilia genica OsNramp de Oryza sativa subsp. japonica. O elementoCACTFTPPCA1 foi o motivo mais frequente na regiao promotora dos genesmembros da familia OsNramp de Oryza sativa subsp. japonica. O objetivo do ultimotrabalho foi comparar as sequencias de ESTs de aveia com as especiesArabidopsis, cevada, arroz, cana-de-acucar, sorgo, trigo e milho, buscando inferirrelacoes evolutivas dessas especies com a aveia. Sequencias de oito especies deplantas disponiveis atualmente, no banco de dados Unigene no National Center forBiotechnology Information - NCBI foram baixadas e as comparacoes com a aveiaforam feitas utilizando as ferramentas de BLASTn e tBLASTx. Observou-se que obanco de ESTs de aveia UNIGENE-NCBI consiste de muitas sequencias poucosimilares a outras especies comparados a nucleotideos (46,72%) e aminoacidos(74,97%). Uma minoria de 4,56% das sequencias presentes no banco de ESTs deaveia UNIGENE-NCBI apresentam alta similaridade com sequencias de especies demono e dicotiledoneas." @default.
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