FRINK Linked Data Fragments server

Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W2772019691> ?p ?o ?g. }

• W2772019691 abstract "Dengue virus surface proteins are often used in the development of vaccines that protect against dengue virus infection. However, the surface proteins on the four serotypes of dengue virus display high variation, which increases the difficulty of developing a vaccine that can protect against all viral strains. In this study, a polytope that is recognized by broadly neutralizing antibodies (bnAbs) was designed using conserved epitopes from the four serotypes.We constructed a polytope using four conserved dengue virus epitopes such that two aligned epitopes were separated from the other two epitopes by a histidyl-tRNA synthetase spacer. The epitopes were selected based on our previous docking studies. We then performed molecular docking of the polytope with the four bnAbs.The polytope bound precisely to the four bnAbs-B7, C8, A11, and C10. Moreover, the polytope had a higher affinity for the bnAbs compared to the DENV2 antigen. The polytope and A11 antibody complex had the lowest binding energy relative to complexes between the polytope and the other three antibodies assessed. The highest total number of hydrogen bonds was found in the polytope and B7 antibody complex. The hydrogen bond length in all the complexes ranged from 2.07 to 3.03 Å, implying that hydrogen bonds stabilized the complexes.The developed polytope interacted with four different bnAbs that recognize the four serotypes of dengue virus. The results of this study suggest that this polytope warrants further development for use in a broad-spectrum vaccine against dengue virus.البروتينات السطحية لفيروس حمى الضنك غالبا ما تستخدم لتطوير اللقاح لمنع العدوى الفيروسية. ومع ذلك، الاختلاف العالي للبروتينات السطحية لأربعة أنماط مصلية لفيروس حمى الضنك تعقّد تطوير اللقاح الذي يمكن أن تغطي جميع سلالات الفيروس. تركز هذه الدراسة على تصميم بوليتوب لحاتمة محفوظة من أربعة أنماط مصلية لفيروس حمى الضنك ضد أجسام مضادة محايدة على نطاق واسع.قمنا بتركيب بوليتوب من أربعة حواتم محفوظة جنبا إلى جنب ترتبط مع إنزيم هيستيديل-تي آر إن أي المخلق كفاصل بين اثنين من الحواتم. استند هذا على بنية بروتين البوليتوب والموقع الجزيئي بين البوليتوب مع أربعة أجسام مضادة محايدة على نطاق واسع.ارتبط البوليتوب بدقة لأربعة أجسام مضادة محايدة على نطاق واسع. علاوة على ذلك، زاد البوليتوب تقارب موقع ربط الأجسام المضادة المحايدة على نطاق واسع بالمقارنة إلى مستضداد DENV2. وأظهر المركب بين بوليتوب والجسم المضاد أ١١ أدنى طاقة رابطة عند مقارنته للثلاثة الأجسام المضادة الأخرى. ووجد أعلى عدد من الروابط الهيدروجينية في البروتين المركب بين بوليتوب والجسم المضاد ب ٧. كما أظهرت الروابط الهيدروجينية لجميع المركبات البروتينية مسافات بين ٢.٠٧- ٣.٠٣ أنغستروم، مما يعني أن الروابط الهيدروجينية وازنت البروتينات المركبة.تفاعلت البوليتوب المطورة مع أربعة أجسام مضادة محايدة على نطاق واسع وتعرفت على الأربعة الأنماط المصلية لفيروس حمى الضنك. توصي نتائج هذه الدراسة أن البوليتوب يحفز المزيد من التطور لإيجاد لقاح واسع السلالة لفيروس حمى الضنك." @default.
• W2772019691 created "2017-12-22" @default.
• W2772019691 creator A5000639922 @default.
• W2772019691 creator A5012822398 @default.
• W2772019691 creator A5023098644 @default.
• W2772019691 creator A5061358082 @default.
• W2772019691 creator A5063354684 @default.
• W2772019691 creator A5080087459 @default.
• W2772019691 date "2018-04-01" @default.
• W2772019691 modified "2023-09-24" @default.
• W2772019691 title "Designing a polytope for use in a broad-spectrum dengue virus vaccine" @default.
• W2772019691 cites W1976707675 @default.
• W2772019691 cites W1981177712 @default.
• W2772019691 cites W1987134040 @default.
• W2772019691 cites W2029055575 @default.
• W2772019691 cites W2038433611 @default.
• W2772019691 cites W2043633676 @default.
• W2772019691 cites W2071101208 @default.
• W2772019691 cites W2071154789 @default.
• W2772019691 cites W2081912151 @default.
• W2772019691 cites W2088807854 @default.
• W2772019691 cites W2097874743 @default.
• W2772019691 cites W2106800284 @default.
• W2772019691 cites W2128163894 @default.
• W2772019691 cites W2150831049 @default.
• W2772019691 cites W2151460035 @default.
• W2772019691 cites W2155201844 @default.
• W2772019691 cites W2156986452 @default.
• W2772019691 cites W2158105592 @default.
• W2772019691 cites W2160023890 @default.
• W2772019691 cites W2167661287 @default.
• W2772019691 cites W2222158372 @default.
• W2772019691 cites W2296204072 @default.
• W2772019691 cites W2306949113 @default.
• W2772019691 cites W2318760165 @default.
• W2772019691 cites W2600080441 @default.
• W2772019691 cites W4292803599 @default.
• W2772019691 doi "https://doi.org/10.1016/j.jtumed.2017.11.002" @default.
• W2772019691 hasPubMedCentralId "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/6695032" @default.
• W2772019691 hasPubMedId "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31435318" @default.
• W2772019691 hasPublicationYear "2018" @default.
• W2772019691 type Work @default.
• W2772019691 sameAs 2772019691 @default.
• W2772019691 citedByCount "0" @default.
• W2772019691 crossrefType "journal-article" @default.
• W2772019691 hasAuthorship W2772019691A5000639922 @default.
• W2772019691 hasAuthorship W2772019691A5012822398 @default.
• W2772019691 hasAuthorship W2772019691A5023098644 @default.
• W2772019691 hasAuthorship W2772019691A5061358082 @default.
• W2772019691 hasAuthorship W2772019691A5063354684 @default.
• W2772019691 hasAuthorship W2772019691A5080087459 @default.
• W2772019691 hasBestOaLocation W27720196911 @default.
• W2772019691 hasConcept C10389963 @default.
• W2772019691 hasConcept C114614502 @default.
• W2772019691 hasConcept C145691206 @default.
• W2772019691 hasConcept C159047783 @default.
• W2772019691 hasConcept C159654299 @default.
• W2772019691 hasConcept C185592680 @default.
• W2772019691 hasConcept C195616568 @default.
• W2772019691 hasConcept C2522874641 @default.
• W2772019691 hasConcept C2779635636 @default.
• W2772019691 hasConcept C33923547 @default.
• W2772019691 hasConcept C533803919 @default.
• W2772019691 hasConcept C54355233 @default.
• W2772019691 hasConcept C86803240 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C10389963 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C114614502 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C145691206 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C159047783 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C159654299 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C185592680 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C195616568 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C2522874641 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C2779635636 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C33923547 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C533803919 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C54355233 @default.
• W2772019691 hasConceptScore W2772019691C86803240 @default.
• W2772019691 hasLocation W27720196911 @default.
• W2772019691 hasLocation W27720196912 @default.
• W2772019691 hasLocation W27720196913 @default.
• W2772019691 hasLocation W27720196914 @default.
• W2772019691 hasLocation W27720196915 @default.
• W2772019691 hasOpenAccess W2772019691 @default.
• W2772019691 hasPrimaryLocation W27720196911 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W1531469403 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2025109096 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2066031420 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2127324477 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2151240643 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2167275396 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2523629975 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2567980438 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2590577640 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2593603457 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2613332501 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2796075691 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2809057058 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2894642457 @default.
• W2772019691 hasRelatedWork W2896935255 @default.

• next