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• W2897539988 abstract "Certains champignons, notamment des Ascomycetes, peuvent synthetiser des metabolites secondaires toxiques pour les hommes et les vertebres, appeles mycotoxines. Etant donne que la presence de ces champignons dans les aliments de base constitue un risque potentiel pour la sante humaine et animale, les aliments de base sont elimines lorsqu'ils sont contamines. La section Flavi est un des groupes de champignons les plus importants du point de vue economique et sanitaire car il comprend des especes productrices de mycotoxines. Parmi les mycotoxines produites par ce groupe se trouvent les aflatoxines (AF), considerees comme une preoccupation majeure en raison de leurs effets deleteres chez les vertebres. Les especes de la section Flavi se developpent principalement dans les regions tropicales et subtropicales car elles beneficient de conditions environnementales optimales. De plus, les conditions de recolte et de stockage sont souvent inappropriees, favorisant ainsi leur developpement. Dans les regions temperees, ces especes se rencontrent moins frequemment. Cependant, le rechauffement climatique pourrait favoriser leur colonisation. L'identification des especes d'Aspergillus de la section Flavi est un defi, en raison de l'inter- et intra-variabilite des caracteres. Par consequent, l'utilisation d'une seule methode d'identification (caracterisation morphologique, moleculaire ou du profil des metabolites secondaires) est insuffisante. Inversement, le developpement d'outils moleculaires a facilite la tâche. Le but de notre etude etait de determiner les relations entre les especes d'Aspergillus de la section Flavi a partir de differents marqueurs moleculaires (ITS, benA, cmdA, amdS, preA, perB, ppgA, aflP, genes Mat1), puis d'identifier ceux qui permettent une classification des especes par inference phylogenetique. L'utilisation de l'inference phylogenetique dans cette etude a montre qu'il s'agit d'une approche robuste pour identifier les especes d'Aspergillus de la section Flavi, notamment en confirmant certaines hypotheses deja proposees pour les especes de la section Flavi. En effet, l'ajout de marqueurs moleculaires a permis de confirmer le placement phylogenetique des especes dans la section Flavi. De plus, une nouvelle espece cryptique a pu etre decrite : Aspergillus korhogoensis (appartenant au clade A. flavus). Notre etude a egalement pu mettre en evidence que les marqueurs moleculaires selectionnes (benA, cmdA, mcm7, rpb1, preB, preA et ppgA) sont de bons candidats pour l'etude d'autres sections d'Aspergillus. L'utilisation de l'inference phylogenetique est une methode elegante permettant d'identifier de facon precise les especes. Sur la base de nos resultats, il est recommande d'utiliser des matrices concatenees pour effectuer une inference phylogenetique dans cette section, et la meilleure combinaison inclut les genes benA, cmdA, et l'inclusion d'un autre gene : mcm7, rpb1, preB, preA ou ppgA. A l'inverse, l'utilisation du gene ITS chez Aspergillus peut conduire a une sous-estimation de la diversite car le gene est tres fortement conserve. L'etude des genes du loci Mat1 dans la section est utile pour accroitre les connaissances sur la reproduction sexuee chez les ascomycetes. De plus, plusieurs fonctions de la machinerie biologique fongique sont liees aux genes du loci Mat1. La caracterisation du profil metabolique secondaire chez les souches d'Aspergillus de la section Flavi doit etre utilisee, non seulement comme outil d'identification, mais egalement pour discriminer les souches toxinogenes et atoxinogenes. La section Flavi renferme des especes capables de produire a la fois de mycotoxines et de composes benefiques. Parmi les mycotoxines qui devraient faire l'objet d'une attention particuliere figurent les AF, l'acide cyclopiazonique, les versicolorines a et b, la sterigmatocystine. Une etude plus approfondie du metabolisme secondaire sera egalement utile pour la recherche de nouveaux composes benefiques." @default.
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