FRINK Linked Data Fragments server

Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W2903383872> ?p ?o ?g. }

• W2903383872 abstract "Τα σύνθετα ρετροτρανσποζόνια SVA (SINE-R, VNTR, Alu) αποτελούν την εξελικτικά νεότερη οικογένεια σύνθετων ρετρομεταθετών στοιχείων στο ανθρώπινο γένωμα. Απαντώνται σε ~2670 αντίγραφα και ενοχοποιούνται για την πρόκληση γενετικών ασθενειών (πχ. λευχαιμία, νευροϊνωμάτωση κλπ) με διάφορους μηχανισμούς. Έχει υποστηριχθεί ότι κινητοποιούνται από την πρωτεΐνη ORF2 των LINE-1 ωστόσο η μεταγραφική τους ρύθμιση παραμένει άγνωστη σε μεγάλο βαθμό.Στην παρούσα μελέτη ανακτήθηκαν, αρχικά, τα πλήρους μήκους SVA του ανθρώπινου γενώματος μέσω της βάσης δεδομένων UCSC. Έγινε κατηγοριοποίηση ανάλογα με τη γενωμική τους θέση και βρέθηκε ότι σχεδόν το σύνολο των SVA εδράζονται παρακείμενα στη θέση έναρξης της μεταγραφής ή εντός γονιδίων. Με στόχο την απομόνωση ενός ενεργού SVA, χρησιμοποιήθηκαν ειδικοί εκκινητές και κλωνοποιήθηκαν μεταγραφήματα SVA από κύτταρα λευχαιμικού ασθενούς. Μέσω νουκλεοτιδικής σύγκρισης (BLAST-NCBI) αποδείχτηκε η ομολογία με ακολουθίες SVA οι οποίες και χαρτογραφήθηκαν στο ανθρώπινο γένωμα. Χρησιμοποιώντας DNA από βλάστες ενός ασθενή με οξεία Β-λεμφοβλαστική λευχαιμία κλωνοποιήθηκε το SVA-C που εδράζεται στο 1ο ιντρόνιο του γονιδίου SMOC-1 (SVASMOC1-L). Ωστόσο αυτό χαρακτηρίστηκε από έλλειψη 347 νουκλεοτιδίων στην περιοχή VNTR σε σχέση με το αντίστοιχο SVA στο γονιδίωμα αναφοράς.Το SVASMOC1-L σημάνθηκε με ειδική κασέτα ανίχνευσης ρετρομετάθεσης που εξασφαλίζει την έκφραση της φθορισμογόνου πρωτεΐνης EGFP αποκλειστικά και μόνο, έπειτα από ένα γεγονός ρετρομετάθεσης (SVA/EGFP-INT). Μετά από διαμόλυνση και ανάλυση FACS σε κυτταρικούς κλώνους βρέθηκε ότι τα θετικά σε ρετρομετάθεση κύτταρα αποτελούσαν το 0.1-32% του συνόλου σε μαζικούς και μονήρεις κλώνους Α549, το 0.5-4.8% σε μαζικούς και μονήρεις κλώνους HeLa και το 4.7-6.3% σε μαζικούς κλώνους Η1299. Διαμόλυνση σε κύτταρα HUT-78 και Jurkat απέδωσε συχνότητες ρετρομετάθεσης 31.7- και 70.8%, αντίστοιχα. Τα γεγονότα ρετρομετάθεσης ανιχνεύθηκαν στις περισσότερες περιπτώσεις μέσω EGFP-θετικών κυττάρων με μικροσκοπία UV, τα οποία περαιτέρω πιστοποιήθηκαν ως γενωμικές ενσωματώσεις με ανάλυση PCR. Τα αυξημένα γεγονότα ρετρομετάθεσης συσχετίστηκαν σε κύτταρα Α549 με αλλαγή φαινοτύπου, φαινόμενα αυτοφαγίας, απόκτηση διηθητικότητας και ιδιοτήτων βλαστικών κυττάρων. Σε κύτταρα κλώνων Α549, βρέθηκε ότι το SVASMOC1-L μπορεί να κινητοποιηθεί από: α. την αντίστροφη μεταγραφάση ORF2 των LINE-1, β. αναστολείς των αποακετυλασών (Τριχοστατίνη-Α και βαλπροϊκό οξύ), γ. το αντικαρκινικό φάρμακο Ετοποσίδιο και δ. επαγόμενο οξειδωτικό στρες από υπεροξείδιο του υδρογόνου και αρσενικό.Τα αποτελέσματα της παρούσας μελέτης αποδεικνύουν πειραματικά για πρώτη φορά ότι: 1. ένα VNTR-ελλειμματικό ρετροτρανσποζόνιο SVA είναι ρετρομεταθετικά ενεργό, 2. πολλαπλασιαστικά ενεργά κύτταρα, όπως τα καρκινικά, παρέχουν τις προϋποθέσεις για την τέλεση γεγονότων ρετρομετάθεσης και 3. ένα SVA με υψηλό δυναμικό ρετρομετάθεσης, μπορεί να συμβάλλει στην κακοήθη εξέλιξη της λευχαιμίας." @default.
• W2903383872 created "2018-12-11" @default.
• W2903383872 creator A5005649502 @default.
• W2903383872 creator A5081877651 @default.
• W2903383872 date "2021-09-15" @default.
• W2903383872 modified "2023-09-24" @default.
• W2903383872 title "Μελέτη του μηχανισμού ρύθμισης της ρετρομετάθεσης" @default.
• W2903383872 doi "https://doi.org/10.12681/eadd/43893" @default.
• W2903383872 hasPublicationYear "2021" @default.
• W2903383872 type Work @default.
• W2903383872 sameAs 2903383872 @default.
• W2903383872 citedByCount "0" @default.
• W2903383872 crossrefType "dissertation" @default.
• W2903383872 hasAuthorship W2903383872A5005649502 @default.
• W2903383872 hasAuthorship W2903383872A5081877651 @default.
• W2903383872 hasConcept C121332964 @default.
• W2903383872 hasConcept C153911025 @default.
• W2903383872 hasConcept C179464577 @default.
• W2903383872 hasConcept C2776090121 @default.
• W2903383872 hasConcept C2777366897 @default.
• W2903383872 hasConcept C54355233 @default.
• W2903383872 hasConcept C81885089 @default.
• W2903383872 hasConcept C86803240 @default.
• W2903383872 hasConcept C8891405 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C121332964 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C153911025 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C179464577 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C2776090121 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C2777366897 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C54355233 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C81885089 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C86803240 @default.
• W2903383872 hasConceptScore W2903383872C8891405 @default.
• W2903383872 hasLocation W29033838721 @default.
• W2903383872 hasOpenAccess W2903383872 @default.
• W2903383872 hasPrimaryLocation W29033838721 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W187443672 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2015509069 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2073729403 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2110740665 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2146792131 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2339566041 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2341405948 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W2743091213 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W3031992762 @default.
• W2903383872 hasRelatedWork W62417376 @default.
• W2903383872 isParatext "false" @default.
• W2903383872 isRetracted "false" @default.
• W2903383872 magId "2903383872" @default.
• W2903383872 workType "dissertation" @default.