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• W2947543579 abstract "Les poissons arc-en-ciel (Melanotaeniidae) se distribuent entre la Nouvelle-Guinee et l'Australie. Ils sont tres recherches en aquariophilie en raison de leur coloration remarquable. Il en existe un tres grand nombre d’especes, dont certaines figurent sur la liste rouge des especes menacees. L’espece Melanotaenia boesemani, l'une des plus populaires au sein de cette famille, est en voie de disparition. L’aquaculture de cette espece apparait donc comme une solution prometteuse pour limiter la capture de specimens sauvages. Pourtant, le nombre de fermes qui elevent M. boesmani est tres faible. Ceci est probablement du aux problemes rencontres par les aquaculteurs, a savoir une proportion plus elevee de femelles par ponte, une perte de la coloration, un taux de croissance et une fecondite plus faibles, ainsi que l’apparition frequente de malformations. Dans ce contexte, cette these visait a produire de nouvelles donnees genetiques en vue d’ameliorer l'aquaculture et la conservation de cette famille. Plus precisement, les objectifs etaient: 1) de developper de nouveaux marqueurs microsatellites a partir d'ADN de M. boesemani, 2) d'evaluer la diversite genetique des populations sauvages de Melanotaenia et d'affiner leur taxonomie, 3) de definir l’origine geographique des souches de M .boesemani elevees en Indonesie, et d'evaluer la pression de consanguinite resultant de cette domestication. Par sequencage haut debit, 12 marqueurs microsatellites ont ete developpes et valides sur l’espece M. boesemani. Les loci correspondant se sont tous reveles polymorphe et des experiences de croisement ont montre qu’ils se conformaient aux lois de Mendel. Ces nouveaux marqueurs ont ensuite ete mis en œuvre pour evaluer la variabilite genetique de 44 populations sauvages (correspondant a 1152 specimens de poissons). Les valeurs de Fis multilocus ont revele que 5 especes presentaient des ecarts significatifs a l’equilibre de Hardy-Weinberg et suggere la presence possible de sous-populations genetiquement differenciees. Combines a une analyse phylogenetique effectuee sur le gene de la cytochrome oxydase I (COI) et a l'observation de plusieurs caracteres morphologiques diagnostic, les 12 marqueurs microsatellites ont egalement permis de caracteriser 8 nouvelles especes non-encore decrites. Enfin, ces marqueurs microsatellites ont ete appliques pour analyser et comparer la variabilite genetique d’echantillons de M. boesemani obtenus a partir de 6 fermes aquacoles autour de Jakarta avec celle des deux populations indigenes de cette espece, a savoir des lacs Ayamaru et Uter (Papouasie occidentale). Les resultats ont indique que toutes les souches eleves provenaient du lac Ayamaru. Aucun deficit en heterozygotes n’a ete mis en evidence, suggerant qu'il n'y avait pas de consanguinite majeure dans ces souches d’elevage. L’analyse des genotypes a egalement suggere que l’espece M. boesemani representait probablement une metapopulation constituee de populations genetiquement differenciees. En definitive, ces resultats indiquaient que les problemes rencontres par les aquaculteurs ne proviennent pas d’une eventuelle consanguinite mais sont plus surement lies a d'autres facteurs tels qu’une gestion inappropriee et / ou une mauvaise qualite des eaux d’elevage. En conclusion, ces nouveaux marqueurs microsatellites se sont averes utiles pour evaluer la structure genetique et la diversite d'un grand nombre d'especes de poisson arc-en-ciel, dont beaucoup sont en voie de disparition. Les resultats presentes ici sur l'une des especes les plus menacees (M. boesemani) montrent qu'il est encore possible d'eviter son extinction. Ceci necessite cependant d'augmenter sa production aquacole afin de soulager rapidement la pression de surpeche. Ceci passe par une meilleure gestion des pratiques d'elevage." @default.
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