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• W2948455837 abstract "Soutenue par le renouveau de la phagotherapie, la decouverte de nouveaux bacteriophages (phages) nous a permis de definir deux nouveaux genres de virus denommes Kpp10virus et Pakpunavirus dont les mecanismes infectieux sont inconnus. Il est admis que le succes d’un cycle infectieux est notamment assure par une reappropriation efficace des ressources de la cellule hote, conduisant a sa transformation en « virocellule », c’est-a-dire, un organisme cellulaire exclusivement dedie a la production de particules virales. Ce travail de these a pour objectif d’apporter une vision globale des strategies moleculaires utilisees par les virus appartenant aux genres Kpp10virus et Pakpunavirus (respectivement representes par les phages PAK_P3 et PAK_P4) pour infecter le pathogene opportuniste Pseudomonas aeruginosa. Dans un premier temps, nous avons evalue leurs proprietes intrinseques en analysant le contenu de leurs genomes, leurs spectres d’hotes, leurs parametres de croissance ainsi qu’en identifiant leur recepteur bacterien. Dans un second temps, une combinaison d’approches transcriptomiques et metabolomiques a permis de montrer que ces deux virus ont des programmes transcriptionnels similaires, incluant notamment une regulation temporelle de leur expression genetique et la production de transcrits antisens. De plus, ils provoquent tous deux la degradation rapide de 90% des ARNm de l’hote, qui sont alors remplaces par des ARNm viraux. Malgre cette degradation, nous avons constate que ces deux phages redirigent les voies de biosynthese bacteriennes plutot que de provoquer une extinction totale du metabolisme cellulaire, en utilisant cependant des mecanismes differents. De plus, nous avons detecte l’activation, par l’hote, d’une reponse commune en reponse a une infection par PAK_P3 ou PAK_P4 et avons emis l’hypothese qu’il s’agit d’une tentative de reparation des importants dommages ARN induits par l’infection virale. Enfin, nous avons etudie les fonctions d’une proteine virale (Gp92), largement conservee chez les virus appartenant a ces deux genres et qui est produite au stade precoce du cycle infectieux. Lorsqu’elle est produite seule chez l’hote, cette proteine altere la morphologie cellulaire et interagit avec un complexe de regulation bacterien de type sigma/anti-sigma implique dans la reponse au stress (appele AlgU-MucA). Notre etude suggere un role potentiel de Gp92 dans l’attenuation du stress provoque par l’infection virale. Ce manuscrit fournit un modele de transformation d’une cellule de P. aeruginosa en « virocellule » au cours de l’infection par PAK_P3 ou PAK_P4. De plus, la comparaison des strategies de ces deux virus, vraisemblablement issus d’un ancetre commun, nous a permis de discuter l’evolution des mecanismes infectieux chez les phages virulents" @default.
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