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- W360461570 abstract "Avant propos L'objectif de cette these est d'explorer l'inflammation et l'infection au niveau du transcriptome, a l'aide de la technologie des puces a ADN. Pour cela, nous avons dans un premier temps travaille sur des donnees publiques. Nous avons construit une base de donnees de signatures transcriptionnelles annotees, et developpe un logiciel modulaire d'analyse. Ce logiciel permet d'explorer aisement les donnees publiques en effectuant des recherches par nom de gene ou par mots-cles. Nous avons ensuite explore la modulation temporelle de l'expression des genes du parenchyme pulmonaire dans un modele murin d'inflammation aigue par injection d'acide oleique. Dans un second modele murin d'infection par Coxiella burnetii, nous avons analyse le role du sexe dans la modulation de la reponse transcriptionnelle hepatique, et identifie des voies metaboliques impliquees dans le controle de l'infection. Dans un troisieme modele in-vitro d'infection par differentes souches du virus de la grippe, nous avons identifie une signature transcriptionnelle commune de reponse a l'infection. Par une approche bio-informatique originale, cette signature a conduit a l'identification de nouveaux anti-viraux a large spectre, dont l'efficacite a ete demontree in-vitro sur les souches utilisees pour l'analyse, et sur la souche H1N1, responsable de la derniere pandemie grippale. Enfin, nous avons analyse les modulations du transcriptome lors de pneumonies associees a la ventilation mecanique compliquant l'evolution de sujets traumatises graves admis en reanimation." @default.
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