FRINK Linked Data Fragments server

Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W4226288052> ?p ?o ?g. }

• W4226288052 endingPage "863" @default.
• W4226288052 startingPage "855" @default.
• W4226288052 abstract "Linkage disequilibrium (LD) of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of TLR4/AL160272.2 (rs1927914, rs1928298, rs7038716, rs7026297, rs7025144) was estimated in the Slavs of West Siberia. We further investigated an association of SNPs in TLR4/AL160272.2 (rs1927914, rs7038716, rs7025144), SERPINA1 (rs1980616), ATXN2/BRAP (rs11065987), IL2RB (rs2284033), NT5C2 (rs11191582), CARD8 (rs11669386), ANG/RNASE4 (rs1010461), and ABTB2/ САТ (rs2022318) genes with bronchial asthma (BA), arterial hypertension (AH) and their comorbidity. Then, the disease-associated SNPs were annotated in silico in relation to their potential regulatory functions. Strong LD was detected between rs1928298 and rs1927914, as well as rs7026297 and rs7038716 in the Slavs of West Siberia. It was found that the rs1927914 G allele of the TLR4 gene and the rs1980616 C allele of the SERPINA1 gene are associated with the predisposition to BA. These SNPs can affect binding affinity of transcription factors of the Pou and Klf4 families, as well as the expression levels of the TLR4 and SERPINA1 genes. The rs11065987 allele A of the ATXN2/BRAP genes, the rs11669386 A allele of the CARD8 gene, the rs2284033 allele G of the IL2RB gene, and the rs11191582 allele G of the NT5C2 gene were associated with the risk of AH. These variants can alter binding affinity of the Hoxa9, Irf, RORalpha1 and HMG-IY transcription factors, as well as the expression levels of the ALDH2, CARD8, NT5C2, ARL3, and SFXN2 genes in blood cells/vessels/heart, respectively. The risk of developing a comorbid phenotype of AD and AH is associated with the A allele of rs7038716 and the T allele of rs7025144 of the TLR4/AL160272.2 genes, the A allele of rs1010461 of the ANG gene and the C allele of rs2022318 of the ABTB2/CAT genes. Variants rs7038716 and rs7025144 can change the expression levels of the TLR4 gene in blood cells, while rs1010461 and rs2022318 influence the expression levels of the ANG and RNASE4 genes as well as the CAT and ABTB2 genes in blood cells, lungs/vessels/heart.В работе оценено неравновесие по сцеплению однонуклеотидных вариантов (SNP) генов TLR4/AL160272.2 (rs1927914, rs1928298, rs7038716, rs7026297, rs7025144) у славян-жителей Западной Сибири. Проведен анализ ассоциаций SNP в области генов TLR4/AL160272.2 (rs1927914, rs7038716, rs7025144), SERPINA1 (rs1980616), ATXN2/BRAP (rs11065987), IL2RB (rs2284033), NT5C2 (rs11191582), CARD8 (rs11669386), ANG/RNASE4 (rs1010461) и ABTB2/САТ (rs2022318) при бронхиальной астме (БА), артериальной гипертензии (АГ) и их со- четании. Выполнено in silico аннотирование SNP, ассоциированных с данными заболеваниями, в отношении их регуляторного потенциала. В результате у славян-жителей Западной Сибири выявлено сильное неравно- весие по сцеплению rs1928298 и rs1927914, а также rs7026297 и rs7038716. Установлено, что к развитию БА предрасполагают аллель G rs1927914 гена TLR4 и аллель С rs1980616 гена SERPINA1. Данные SNP влияют на изменение аффинности транскрипционных факторов семейств Pou и Klf4, а также на экспрессию генов TLR4 и SERPINA1 в клетках крови соответственно. Аллель А rs11065987 генов ATXN2/BRAP, аллель А rs11669386 гена CARD8, аллель G rs2284033 гена IL2RB и аллель G rs11191582 гена NT5C2 ассоциированы с риском развития артериальной гипертензии. Данные варианты изменяют аффинность транскрипционных факторов Hoxa9, Irf, RORalpha1 и HMG-IY, а также экспрессию генов ALDH2, CARD8, NT5C2, ARL3 и SFXN2 в клетках крови, сосудах и сердце. Риск развития коморбидного фенотипа БА и АГ ассоциирован с аллелем А rs7038716 и аллелем Т rs7025144 генов TLR4/AL160272.2, аллелем А – rs1010461 гена ANG и аллелем С – rs2022318 генов ABTB2/САТ. Варианты rs7038716 и rs7025144 изменяют экспрессию гена TLR4 в клетках крови, а rs1010461 и rs2022318 – генов ANG и RNASE4, CAT и ABTB2 в клетках крови, легких, сосудов и сердца." @default.
• W4226288052 created "2022-05-05" @default.
• W4226288052 creator A5003106718 @default.
• W4226288052 creator A5003437742 @default.
• W4226288052 creator A5011925076 @default.
• W4226288052 creator A5027828018 @default.
• W4226288052 creator A5060781017 @default.
• W4226288052 date "2022-01-01" @default.
• W4226288052 modified "2023-09-26" @default.
• W4226288052 title "Putative regulatory functions of SNPs associated with bronchial asthma, arterial hypertension and their comorbid phenotype" @default.
• W4226288052 cites W107220021 @default.
• W4226288052 cites W1647449973 @default.
• W4226288052 cites W1752957211 @default.
• W4226288052 cites W1964669406 @default.
• W4226288052 cites W1982807310 @default.
• W4226288052 cites W1993362238 @default.
• W4226288052 cites W1995056031 @default.
• W4226288052 cites W2000744435 @default.
• W4226288052 cites W2006650628 @default.
• W4226288052 cites W2010144072 @default.
• W4226288052 cites W2022440570 @default.
• W4226288052 cites W2022765352 @default.
• W4226288052 cites W2028205665 @default.
• W4226288052 cites W2029910307 @default.
• W4226288052 cites W2057906448 @default.
• W4226288052 cites W2121187319 @default.
• W4226288052 cites W2135199713 @default.
• W4226288052 cites W2141942431 @default.
• W4226288052 cites W2153118028 @default.
• W4226288052 cites W2165277651 @default.
• W4226288052 cites W2174384765 @default.
• W4226288052 cites W2411471160 @default.
• W4226288052 cites W2468078563 @default.
• W4226288052 cites W2602433136 @default.
• W4226288052 cites W2725633324 @default.
• W4226288052 cites W2752191443 @default.
• W4226288052 cites W2772032611 @default.
• W4226288052 cites W2793196339 @default.
• W4226288052 cites W2898855467 @default.
• W4226288052 cites W2905035078 @default.
• W4226288052 cites W2907197357 @default.
• W4226288052 cites W2915864432 @default.
• W4226288052 cites W2968019312 @default.
• W4226288052 cites W3009383606 @default.
• W4226288052 cites W3017088606 @default.
• W4226288052 cites W3021594163 @default.
• W4226288052 cites W3049789231 @default.
• W4226288052 cites W3207728227 @default.
• W4226288052 doi "https://doi.org/10.18699/vj21.099" @default.
• W4226288052 hasPubMedId "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35088020" @default.
• W4226288052 hasPublicationYear "2022" @default.
• W4226288052 type Work @default.
• W4226288052 citedByCount "1" @default.
• W4226288052 countsByYear W42262880522023 @default.
• W4226288052 crossrefType "journal-article" @default.
• W4226288052 hasAuthorship W4226288052A5003106718 @default.
• W4226288052 hasAuthorship W4226288052A5003437742 @default.
• W4226288052 hasAuthorship W4226288052A5011925076 @default.
• W4226288052 hasAuthorship W4226288052A5027828018 @default.
• W4226288052 hasAuthorship W4226288052A5060781017 @default.
• W4226288052 hasBestOaLocation W42262880521 @default.
• W4226288052 hasConcept C104317684 @default.
• W4226288052 hasConcept C135763542 @default.
• W4226288052 hasConcept C153209595 @default.
• W4226288052 hasConcept C180754005 @default.
• W4226288052 hasConcept C35605836 @default.
• W4226288052 hasConcept C54355233 @default.
• W4226288052 hasConcept C86803240 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C104317684 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C135763542 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C153209595 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C180754005 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C35605836 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C54355233 @default.
• W4226288052 hasConceptScore W4226288052C86803240 @default.
• W4226288052 hasIssue "8" @default.
• W4226288052 hasLocation W42262880521 @default.
• W4226288052 hasLocation W42262880522 @default.
• W4226288052 hasLocation W42262880523 @default.
• W4226288052 hasLocation W42262880524 @default.
• W4226288052 hasLocation W42262880525 @default.
• W4226288052 hasOpenAccess W4226288052 @default.
• W4226288052 hasPrimaryLocation W42262880521 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W1966708416 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2030117176 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2057739827 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2069461486 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2081569445 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2087198772 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2159152816 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2223919059 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2369752866 @default.
• W4226288052 hasRelatedWork W2410452464 @default.
• W4226288052 hasVolume "25" @default.
• W4226288052 isParatext "false" @default.
• W4226288052 isRetracted "false" @default.
• W4226288052 workType "article" @default.