FRINK Linked Data Fragments server

Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W4292099754> ?p ?o ?g. }

• W4292099754 abstract "H λοίμωξη με Helicobacter pylori προωθεί την εμφάνιση χρόνιας ενεργού γαστρίτιδας και πληθώρας DNA βλαβών, συμπεριλαμβανομένων θραύσεων της αλυσίδας του DNA, μικροδορυφορική αστάθεια, επιγενετικές μεταβολές, πλαισιοτροποποιητικές και σημειακές μεταλλαγές. Τα γαστρικά επιθηλιακά κύτταρα, προκειμένου να αποτρέψουν την εμφάνιση γενωμικής αστάθειας, απαιτούν την ακεραιότητα των μηχανισμών επιδιόρθωσης του DNA, οι οποίοι, ωστόσο, έχουν αναφερθεί πως επηρεάζονται από τη λοίμωξη. Η πρωτεΐνη CagA αποτελεί κύριο παράγοντα παθογένειας του H. pylori, ο οποίος απορρυθμίζει μια σειρά κυτταρικών διαδικασιών του ξενιστή όπως τη φλεγμονώδη απόκριση, τον κυτταρικό πολλαπλασιασμό, την απόπτωση και τη γενωμική σταθερότητα. Η παθογενής ενδοκυττάρια δράση της ρυθμίζεται, εν μέρει, από ιεραρχικές φωσφορυλιώσεις τυροσίνης σε επαναλαμβανόμενες αμινοξικές αλληλουχίες του τύπου EPIYA, από κινάσες του ξενιστή. Ο στόχος της παρούσας διατριβής ήταν να αναγνωριστούν δυνητικές επιπτώσεις της H. pylori λοίμωξης και της πρωτεΐνης CagA στους μηχανισμούς επιδιόρθωσης του DNA. Για αυτό το σκοπό, μελετήθηκε το μεταγράφωμα κυττάρων AGS κατόπιν λοίμωξης με H. pylori στελέχη άγριου τύπου, ΔCagA αλλά και στελέχη με αδυναμία φωσφορυλίωσης της CagA στις καρβόξυ-τελικές αλληλουχίες EPIYA. Έπειτα από ανάγνωση της RNA αλληλουχίας (RNA-sequencing) σε polyA-επιλεγμένα μετάγραφα, πραγματοποιήθηκε Ανάλυση Διαφορικής Έκφρασης, Ανάλυση Βιολογικών Μονοπατιών καθώς και οπτικοποίηση των αποτελεσμάτων στους χάρτες μεταγωγής σήματος της KEGG ανά επιδιορθωτικό μηχανισμό του DNA. Κομβικά γονίδια της επιδιόρθωσης DNA που παρατηρήθηκαν μειορρυθμισμένα με CagA-σχετιζόμενο τρόπο, αναλύθηκαν περαιτέρω και σε επίπεδο πρωτεϊνικής έκφρασης με ανάλυση κατά Western, αξιοποιώντας τις γαστρικές επιθηλιακές κυτταρικές σειρές AGS και GES-1. Επιπροσθέτως, μελέτη για την επίπτωση της H. pylori λοίμωξης, καθώς και της έκφρασης της πρωτεΐνης CagA, στην ακεραιότητα του γενώματος πραγματοποιήθηκε με τη χρήση αλκαλικής Comet assay και ανάλυσης της παραγωγής γH2AX με ανάλυση κατά Western. Η ανάλυση μεταγραφώματος αποκάλυψε πως ένας αξιοσημείωτος αριθμός γονιδίων της επιδιόρθωσης του DNA απορρυθμίζεται κατά τη H. pylori λοίμωξη, οδηγώντας δυνητικά σε εξασθένιση των μηχανισμών Επιδιόρθωσης Μέσω Εκτομής Βάσης και της Επιδιόρθωσης Αναντιστοιχίας και μιας πιο περίπλοκης απορρύθμισης των μηχανισμών της Επιδιόρθωσης Μέσω Εκτομής Νουκλεοτιδίου και Ομόλογου Ανασυνδυασμού. Η έκφραση της βακτηριακής πρωτεΐνης CagA παρατηρήθηκε ότι συμβάλει στη μειορρύθμιση των Nth Like DNA Glycosylase 1 (NTHL1), MutY DNA Glycosylase (MUTYH), Flap Structure-Specific Endonuclease 1 (FEN1), RAD51 Recombinase, DNA Polymerase Delta Catalytic Subunit (POLD1), και DNA Ligase 1 (LIG1) και, σε αντίθεση με τα δεδομένα μεταγραφώματος, στην αυξορρύθμιση της Apurinic/Apyrimidinic Endodeoxyribonuclease 1 (APE1). Επιπλέον, η H. pylori λοίμωξη παρατηρήθηκε να επάγει το σχηματισμό θραύσεων της διπλής έλικας του DNA, όπως καταγράφεται από την επαγωγή σχηματισμού γH2AX, ανεξάρτητα από την έκφραση της CagA. Ωστόσο, η πρωτεΐνη CagA, στο πλαίσιο της λοίμωξης, σύμφωνα με την ανάλυση Comet assay προτείνεται να προωθεί την αύξηση, ως σύνολο, του σχηματισμού απουρινικών/απυριμιδινικών σημείων, εγκοπών, αλλοιώσεων των βάσεων και θραύσεων της έλικας του DNA. Η παρούσα διατριβή αναδεικνύει το ρόλο της πρωτεΐνης CagA, ως σημαντικού παράγοντα της H. pylori-επαγόμενης απορρύθμισης της επιδιόρθωσης του DNA κατά τη λοίμωξη, διαταράσσοντας δυνητικά την ισορροπία μεταξύ εμφάνισης και επιδιόρθωσης των DNA βλαβών, ευνοώντας με αυτό το τρόπο την εμφάνιση γενωμικής αστάθειας και συνεισφέροντας στην ανάπτυξη γαστρικού καρκίνου." @default.
• W4292099754 created "2022-08-17" @default.
• W4292099754 creator A5086647711 @default.
• W4292099754 date "2022-08-17" @default.
• W4292099754 modified "2023-09-24" @default.
• W4292099754 title "Επίπτωση της λοίμωξης του Ελικοβακτηρίου του πυλωρού (Helicobacter pylori) στους μηχανισμούς επιδιόρθωσης του DNA" @default.
• W4292099754 doi "https://doi.org/10.12681/eadd/52070" @default.
• W4292099754 hasPublicationYear "2022" @default.
• W4292099754 type Work @default.
• W4292099754 citedByCount "0" @default.
• W4292099754 crossrefType "dissertation" @default.
• W4292099754 hasAuthorship W4292099754A5086647711 @default.
• W4292099754 hasConcept C104317684 @default.
• W4292099754 hasConcept C134935766 @default.
• W4292099754 hasConcept C153911025 @default.
• W4292099754 hasConcept C156719811 @default.
• W4292099754 hasConcept C175114707 @default.
• W4292099754 hasConcept C192396546 @default.
• W4292099754 hasConcept C2776409635 @default.
• W4292099754 hasConcept C2778204961 @default.
• W4292099754 hasConcept C31254050 @default.
• W4292099754 hasConcept C49105822 @default.
• W4292099754 hasConcept C54355233 @default.
• W4292099754 hasConcept C552990157 @default.
• W4292099754 hasConcept C60987743 @default.
• W4292099754 hasConcept C86803240 @default.
• W4292099754 hasConcept C88354546 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C104317684 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C134935766 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C153911025 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C156719811 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C175114707 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C192396546 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C2776409635 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C2778204961 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C31254050 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C49105822 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C54355233 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C552990157 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C60987743 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C86803240 @default.
• W4292099754 hasConceptScore W4292099754C88354546 @default.
• W4292099754 hasLocation W42920997541 @default.
• W4292099754 hasOpenAccess W4292099754 @default.
• W4292099754 hasPrimaryLocation W42920997541 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W134136924 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2000479074 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2025668322 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2029127611 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2053929263 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2065032548 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2091591103 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2101896454 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W2167714751 @default.
• W4292099754 hasRelatedWork W3197394346 @default.
• W4292099754 isParatext "false" @default.
• W4292099754 isRetracted "false" @default.
• W4292099754 workType "dissertation" @default.