FRINK Linked Data Fragments server

Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W4306779856> ?p ?o ?g. }

• W4306779856 abstract "Τα λιπαρά οξέα αποτελούν τις κύριες δομικές μονάδες των σύνθετων λιπιδίων. Η μεταφορά τους στη συστηματική λειτουργία και η κατανομή τους στους ιστούς επιτυγχάνεται με τη μεταφέρουσα πρωτεΐνη αλβουμίνη (BSA/HSA). Με τη χρήση κρυσταλλογραφίας ακτίνων-Χ και φασματοσκοπίας NMR έχει βρεθεί ότι υπάρχουν επτά θέσεις πρόσδεσης των λιπαρών οξέων στην αλβουμίνη. Η θέση πρόσδεσης 7 (FA7) συμπίπτει με τη θέση Ι των φαρμάκων (βαρφαρίνη), ενώ η θέση πρόσδεσης 3 (FA3) με τη θέση ΙΙ των φαρμάκων (ιβουπροφαίνη). Πρόσφατες μελέτες αντικαρκινικής δράσης των απαραίτητων ω-3 και ω-6 λιπαρών οξέων, απέδειξαν τη μείωση των επιπέδων έκφρασης της αντι-αποπτωτικής πρωτεΐνης Bcl-2. Το αποτέλεσμα αυτό σε συνδυασμό με τη δομική ομοιότητα των ακόρεστων λιπαρών οξέων με αναστολείς της Bcl-2 υποδεικνύει την προ-αποπτωτική δράση των λιπαρών οξέων ως πιθανό μηχανισμό. Όμως, τα δομικά χαρακτηριστικά αλληλεπίδρασης των λιπαρών οξέων με την Bcl-2 καθώς και ο μηχανισμός της αντικαρκινικής τους δράσης παραμένει άγνωστος. Βασικοί στόχοι της διδακτορικής διατριβής, με τη χρήση σύγχρονων μεθοδολογιών NMR, είναι η διερεύνηση: (α) της μοριακής βάσης αλληλεπίδρασης ακόρεστων FFA με μη επισημασμένη αλβουμίνη ορού, (β) της μη ομοιοπολικής έναντι της ομοιοπολικής πρόσδεσης νιτρο-παραγώγων του ελαϊκού οξέος με HSA, (γ) της μοριακής βάσης αλληλεπίδρασης πολυακόρεστων FFA με την αντι-αποπτωτική πρωτεΐνη Bcl-2 και (δ) δομικών και διαμορφωτικών χαρακτηριστικών αλληλεπιδράσεων πολυακόρεστου λιπαρού οξέος DHA με τη Bcl-2, σε κυτταρικό επίπεδο σε ζωντανά καρκινικά κύτταρα που υπερεκφράζουν τον υποδοχέα. Εφαρμόστηκε, για πρώτη φορά, η συνδυαστική χρήση τεχνικών NMR διαφοράς μεταφοράς κορεσμού (STD), μεταφερόμενου φαινομένου Overhauser (Tr-NOESY), διαμοριακών σημάτων ΝΟΕ για φαρμακοφόρο χαρτογράφηση (INPHARMA) και υπολογισμών docking με στόχο τη μελέτη αλληλεπιδράσεων των λιπαρών οξέων καπρολεϊκού οξέος, ελαϊκού οξέος, λινελαϊκού οξέος, α-λινολενικού οξέος, EPA και DHA με μη επισημασμένη αλβουμίνη ορού. Με τη χρήση ανταγωνιστικών πειραμάτων με τα φάρμακα βαρφαρίνη και ιβουπροφαίνη παρατηρήθηκαν σημαντικά διαμοριακά ΝΟΕ μεταξύ των λιπαρών οξέων και των φαρμάκων, που αντανακλούν τις διαμορφωτικές καταστάσεις των λιπαρών οξέων στις θέσεις πρόσδεσης των φαρμάκων στην HSA. Τα διαμοριακά σήματα ΝΟΕ και οι υπολογισμοί docking ερμηνεύτηκαν σε όρους σημαντικής αναδίπλωσης της δις-αλλυλικής περιοχής και παρουσίας δύο προσανατολισμών των λιπαρών οξέων στη θέση πρόσδεσης της βαρφαρίνης, λόγω ύπαρξης δύο ομάδων πολικών αμινοξέων που έχουν το ρόλο μοριακής άγκυρας. Αυτή η διαμορφωτική ευελιξία των λιπαρών οξέων στη θέση πρόσδεσης της βαρφαρίνης είναι ο κύριος λόγος για τον οποίο δεν κατέστη δυνατός ο ακριβής προσδιορισμός με ακτίνες-Χ, παρά τις πολυάριθμες βιβλιογραφικές δομικές μελέτες. NMR μελέτες της αλληλεπίδρασης του 9/10-νιτρο-ελαϊκού οξέος (9/10-ΝΟ2-ΟΑ) με την αλβουμίνη ερμηνεύτηκαν σε όρους μη ομοιοπολικής πρόσδεσης του 9/10-ΝΟ2-ΟΑ στην HSA. Με τη χρήση ανταγωνιστικών πειραμάτων του ελαϊκού οξέος και των φαρμάκων ιβουπροφαίνης και βαρφαρίνης διαπιστώθηκε ότι το 9/10-NO2-OA έχει υψηλότερη συγγένεια πρόσδεσης στην HSA σε σχέση με το ελαϊκό οξύ και τη βαρφαρίνη, ενώ με την ιβουπροφαίνη έχει παρόμοια συγγένεια πρόσδεσης. Με τη συνδυαστική χρήση των τεχνικών STD και tr-NOESY NMR διερευνήθηκε η αλληλεπίδραση των λιπαρών οξέων με την αντι-αποπτωτική πρωτεΐνη Bcl-2 σε διάλυμα buffer. Ανταγωνιστικά πειράματα των FFA με τον αναστολέα ABT-263 ερμηνεύτηκαν σε όρους συνεργατικής αλληλεπίδρασης, με εξαίρεση το EPA που έδειξε ανταγωνιστική δράση. Η μεθοδολογία in-cell NMR χρησιμοποιήθηκε, για πρώτη φορά, στη μελέτη αλληλεπίδρασης του DHA με την αντι-αποπτωτική πρωτεΐνη Bcl-2 σε ζωντανά καρκινικά κύτταρα Jurkat Bcl-2 που υπερεκφράζουν τον υποδοχέα. Αποδείχθηκε ότι το DHA εισέρχεται στα κύτταρα και αλληλεπιδρά σχεδόν αποκλειστικά με τη Bcl-2 και όχι με άλλους πρωτεϊνικούς υποδοχείς. Ανταγωνιστικό πείραμα του DHA με τον αναστολέα ABT-263 έδειξε ανταγωνιστική αλληλεπίδραση, σε αντίθεση με τη συνεργατική αλληλεπίδραση με Bcl-2 σε διάλυμα buffer." @default.
• W4306779856 created "2022-10-19" @default.
• W4306779856 creator A5076160129 @default.
• W4306779856 date "2022-10-19" @default.
• W4306779856 modified "2023-10-18" @default.
• W4306779856 title "Μελέτη αλληλεπιδράσεων ακόρεστων λιπαρών οξέων με την αλβουμίνη ορού και την αντι-αποπτωτική πρωτεϊνη Bcl-2 με έμφαση στη χρήση μεθοδολογιών NMR κυτταρικού επιπέδου (in-cell NMR)" @default.
• W4306779856 doi "https://doi.org/10.12681/eadd/52409" @default.
• W4306779856 hasPublicationYear "2022" @default.
• W4306779856 type Work @default.
• W4306779856 citedByCount "0" @default.
• W4306779856 crossrefType "dissertation" @default.
• W4306779856 hasAuthorship W4306779856A5076160129 @default.
• W4306779856 hasConcept C103319777 @default.
• W4306779856 hasConcept C116447816 @default.
• W4306779856 hasConcept C119851462 @default.
• W4306779856 hasConcept C163111631 @default.
• W4306779856 hasConcept C185592680 @default.
• W4306779856 hasConcept C19549132 @default.
• W4306779856 hasConcept C66974803 @default.
• W4306779856 hasConcept C71240020 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C103319777 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C116447816 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C119851462 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C163111631 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C185592680 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C19549132 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C66974803 @default.
• W4306779856 hasConceptScore W4306779856C71240020 @default.
• W4306779856 hasLocation W43067798561 @default.
• W4306779856 hasOpenAccess W4306779856 @default.
• W4306779856 hasPrimaryLocation W43067798561 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W1970699746 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W1984174475 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W1990616020 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W2032862540 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W2084150520 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W2359461102 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W2588271746 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W3150982967 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W3197623521 @default.
• W4306779856 hasRelatedWork W4250708963 @default.
• W4306779856 isParatext "false" @default.
• W4306779856 isRetracted "false" @default.
• W4306779856 workType "dissertation" @default.