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- W564032415 abstract "Les ecosystemes cotiers sont des milieux complexes au sein desquels les communautes microbiennes, jouant un role majeur dans leur fonctionnement et leur maintien, s’adaptent et sont tolerantes a des conditions environnementales fluctuantes. En effet, au rythme des marees et de l'activite de la macrofaune, des oscillations oxie/anoxie influencent la composition et la dynamique des communautes microbiennes et par consequent leur implication metabolique. Afin d’apprehender le devenir du petrole dans ces ecosystemes, il est donc indispensable d’apporter des connaissances sur l’ecologie des microorganismes intervenant dans son elimination, notamment dans des conditions oscillantes anoxie/oxie. Ainsi, ce travail de these a eu pour objectif de decrypter l’assemblage de communautes microbiennes hydrocarbonoclastesde sediments intertidaux soumises a des oscillations anoxie/oxie en presence de petrole lors d’une experience en bioreacteurs. Les reponses ecologiques des communautes bacteriennes globales et de micro-organismes sulfato-reducteurs en conditions oscillantes ont pu etre decrites en comparaison avec celles obtenues en conditions d’oxie ou d’anoxie permanentes, par l’analyse des donnees obtenues par sequencage haut-debit des genes de l’ARN 16S et dsrB au niveau transcriptionnel. Ces etudes comparatives ont mis en evidence des profils ecologiques en reponseaux conditions oscillantes, pouvant etre repandus dans differents environnements marins cotiers. En reponse a ces conditions particulieres, de nombreux microorganismes semblent avoir le potentiel a tolerer et/ou s’adapter aux differentes conditions d'oxygenation. Cette capacite d’acclimatation rapide des communautes bacteriennes aux conditions oscillantes se sont accompagnees de capacites de degradation equivalentes ou superieures dans ces conditions par rapport a la condition d’oxie permanente montrant l’influence des oscillations anoxie/oxie sur le devenir du polluant dans les environnements pollues soumis a ces conditions." @default.
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