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- W588673360 abstract "Les mutations de resistance genotypiques constituent un probleme majeur pour l’optimisation du traitement antiretroviral chez les patients infectes par le VIH-1 naifs au traitement ou pretraites. Cependant, l’analyse de l’impact des mutations sur la reponse au traitement est compliquee par i) le nombre eleve de mutations, ii) la colinearite possible entre ces mutations, iii) le faible nombre de patients inclus dans les etudes et iv) la definition du critere de jugement. Les objectifs de cette these sont 1) de donner une vue d’ensemble et de discuter, en collaboration avec le reseau europeen NEAT (European AIDS treatment network), les criteres de jugement utilises dans les essais cliniques recents et ceux utilises lors de l’analyse des mutations de resistance, 2) d’evaluer l’impact des mutations genotypiques sur la reponse au traitement chez les patients naifs dans le cadre d’une grande collaboration Europeenne (EuroCoord-CHAIN) et 3) de comparer des methodes adaptees pour les donnees a haute-dimension dans le but de construire un score genotypique pour la prediction de la reponse virologique chez les patients pretraites. Les criteres de jugement composites sont les plus utilises dans les essais cliniques recents mais un critere purement virologique devrait etre utilise pour l’analyse de l’impact des mutations genotypiques. Les mutations de resistance transmises impactent sur la reponse a la premiere ligne de traitement si le traitement antiretroviral n’est pas adapte au genotype du virus du patient. L’analyse en composantes principales et l’analyse partial least square avaient une bonne capacite a predire la reponse virologique mais n'etaient guere meilleures que le score genotypique. Nous allons continuer a travailler sur la comparaison de ces methodes utilisant des criteres de jugement differents dans le cadre de notre collaboration avec le Forum for collaborative HIV research." @default.
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