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• W628253359 abstract "Les picocyanobacteries marines des genres Prochlorococcus et Synechococcus sont les organismes photosynthetiques les plus abondants de la planete et ils contribuent de facon substantielle a la production primaire mondiale. Alors que le genre Prochlorococcus se caracterise par sa forte abondance dans les regions oligotrophes et son genome reduit, le genre Synechococcus se distingue par sa grande diversite genetique et pigmentaire ainsi qu'une aire de distribution plus etendue.Le principal objectif de ce travail a ete de mettre en relation la diversite genetique de ces organismes avec leur niche ecologique par des approches de genomique comparative et de metagenomique. Tout d'abord, le developpement d'une methode de scaffolding (WiseScaffolder) a permis de clore 32 nouveaux genomes de Synechococcus, lesquels ont ete integres au systeme d'information Cyanorak, dedie a l'annotation de genes orthologues. Ces nouveaux genomes, completant les 65 genomes disponibles pour ces deux genres, ont fait l'objet d'analyses comparatives afin de mieux comprendre la diversite et l'evolution de ce phylum et de definir les genes specifiques de differents groupes phylogenetiques, potentiellement lies a leur adaptation a des niches ecologiques distinctes.Ces genomes ont ensuite ete utilises comme reference, en conjonction avec le gene marqueur petB, pour analyser les donnees de metagenomique issues de l'expedition TARA-Oceans. Ces analyses ont notamment mis en lumiere la diversite genetique, la distribution et l'importance ecologique de certains clades phylogenetiques. Ce travail souleve de nouvelles hypotheses quant au role des picocyanobacteries dans le fonctionnement global des oceans." @default.
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