Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W640924108> ?p ?o ?g. }
- W640924108 abstract "La formation d'agregats proteiques insolubles et fibreux, appeles fibrilles amyloides, est impliquee dans une large variete de maladies humaines. Parmi elles, figurent entre autres, le diabete de type II, l'arthrite rhumatoide et, notamment, les atteintes neurodegeneratives debilitantes, telles que les maladies d'Alzheimer, de Parkinson ou encore de Huntington. Actuellement, il n'existe ni traitement, ni diagnostic precoce pour aucune de ces maladies.De nombreuses etudes ont montre que la capacite a former des fibrilles amyloides est une propriete inherente a la chaine polypeptidique. Ce constat a conduit au developpement d'un certain nombre d'approches computationnelles permettant de predire les proprietes amyloidogeniques a partir de sequences d'amino-acides. Si ces methodes s'averent tres performantes vis a vis de courts peptides (~ 6 residus), leur application a des sequences plus longues correspondant aux peptides et proteines en lien avec les maladies, engendre un nombre trop eleve de faux positifs. Le principal objectif de cette these consiste a developper une meilleure approche bioinformatique, capable de predire les regions amyloidogeniques a partir d'une sequence proteique. Recemment, l'utilisation de nouvelles techniques experimentales a permis de mieux apprehender la structure des amyloides. Il est ainsi apparu que l'element caracteristique de la majorite des fibrilles amyloides impliquees dans les maladies, etait constitue d'une structure etagee (β-arcade), resultant de l'empilement de motifs « feuillet β – coude – feuillet b » appeles « β-arches ». Nous avons mis a profit cette particularite structurale pour creer une approche bioinformatique permettant de predire les regions amyloidogeniques d'une proteine a partir de l'information contenue dans sa sequence. Les resultats provenant de l'analyse des structures de type β-arcade, connues et modelisees, ont ete compiles et traites a l'aide d'un algorithme ecrit en langage Java, afin de creer le programme ArchCandy.L'application de ce programme a une selection de sequences proteiques et peptidiques, connues pour leur lien avec les maladies, a permis de demontrer qu'il etait en mesure de predire correctement la majorite de ces sequences, de meme que les sequences mutees impliquees dans les maladies familiales. Outre la prediction de regions a haut potentiel amyloide, ce programme suggere la conformation structurale adoptee par les fibrilles amyloides. Le sequencage de genomes entiers devenant toujours plus abordable, notre methode offre une perspective de determination individuelle des profils a risque, vis a vis de maladies neurodegeneratives, liees a l'âge ou autres. Elle s'inscrit ainsi pleinement dans l'ere de la medecine personnalisee." @default.
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