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- W655181856 abstract "La fermentation œnologique et le vieillissement oxydatif des vins sous voile representent des modes de vie tres contrastes qui sont effectues par deux lignees differentes de souches de levures de l'espece Saccharomyces cerevisiae. Dans cette these, nous avons compare le genome de souches de levures de voile a celui de levures de vin afin de detecter leurs specificites. Nous tout d'abord selectionne 16 souches (8 levures de vin et 8 levures de voile) isolees en France, Hongrie, Italie et Espagne, pour sequencer leur genome sur une plateforme Illumina (HiSeq2000). Nous avons egalement developpe un ensemble de souches de vin et de voile haploides pour l'evaluation moleculaire de differentes cibles. Nous avons egalement mis au point un milieu synthetique mimant le vin a cette fin. A partir de la comparaison des sequences du genome nous avons etabli une phylogenie qui montre que les levures de voile representent un groupe specifique de levure, differentes des levures de vin, puis a partir de differentes methodes (analyse en composantes principale, diversite nucleotidique et D de Tajima) nous avons identifie des regions divergentes. Ces regions variantes comprennent des genes remplissant plusieurs fonctions cle associees a la croissance en voile. En particulier, des variations alleliques ont ete rencontrees chez les levures de voile pour plusieurs genes impliques dans la regulation de l'expression de FLO11 tels que les voies MAP kinase, ou des voies Ras/cAMP/PKA, ainsi que pour plusieurs genes impliques dans l'homeostasie des cations divalents de metaux de transition tels que le zinc, le cuivre ou le fer. La comparaison des transcriptomes d'une levure de voile et d'une levure de vin sur notre milieu synthetique a revele des differences d'expression pour les floculines (FLO1, 5, 8, 11) ainsi que pour le transport des hexoses, mais a egalement suggere que la levure de voile P3-D5 etait en situation de carence en zinc et en inositol par rapport a la levure de vin, tandis que la levure de vin K1 exprimait certains genes suggerant des defauts mitochondriaux. L'impact de la variation allelique de plusieurs genes a ete evalue dans le phenotype de voile: le transporteur de zinc a haute affinite Zrt1 ainsi que la pyruvate decarboxylase majeure Pdc1." @default.
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