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- W79235786 abstract "Die vorliegende Arbeit behandelt die Untersuchung und Optimierung der Probengenerierung zur quantitativen Metabolomanalyse von Mikroorganismen. Durch eine detaillierte Betrachtung aller Arbeitsschritte wie Biomassebestimmung, Probenahme, Quenching, Zellseparation, Analytik und Datenprozessierung konnten alle Einflussgrosen des Gesamtverfahrens charakterisiert werden. Insbesondere konnte gezeigt werden, dass die wesentlichen Grundlagen einer belastbaren Metabolomanalyse die Berucksichtigung der Heterogenitat von bakteriellen Populationen und die differenzierte Erfassung des Biovolumens als Referenzgrose sind. Zudem belegt die vorliegende Arbeit, dass im Verlauf von Batch-Kultivierungen teilweise hohe extrazellulare Metabolitkonzentrationen auftreten und damit ein simultanes Quenching nur in ausgewahlten Fallen anwendbar ist. Daruber hinaus wurde nachgewiesen, dass die Messmatrix bei der Durchfuhrung von LC-ESI-MS/MS-Messungen auch unter Verwendung interner Standards einen erheblichen Einfluss besitzt. Auf Basis eines umfangreichen Methodenvergleichs fur die Durchfuhrung jedes Teilschrittes und der daraus resultierenden Optimierung ausgewahlter Einzelmethoden konnte ein Standardprozess zur Metabolomanalyse etabliert werden. Die Funktionalitat des Standardprozesses wurde anhand einer vergleichenden Metabolomanalyse von vier Corynebacterium glutamicum-Stammen erfolgreich nachgewiesen. Abschliesend konnte ein Konzept zur automatisierten Anwendung des optimierten Protokolls erstellt werden. Fur die Arbeitsschritte Quenching und Zellseparation wurden dazu eigene technische Losungen entwickelt und umgesetzt." @default.
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