Matches in SemOpenAlex for { <https://semopenalex.org/work/W847044513> ?p ?o ?g. }
- W847044513 abstract "In this thesis we develop a multi-scale model of the evolutionary dynamics of a population of cells, which accounts for the mapping between genotype and phenotype as determined by a model of the gene regulatory network. We study topological properties of genotype-phenotype networks obtained from the multi-scale model. Moreover, we study the problem of evolutionary escape and survival taking into account a genotype-phenotype map.
 An outstanding feature of populations with genotype-phenotype map is that selective pressures are determined by the phenotype, rather than genotypes. Our multi-scale model generates the evolution of a genotype-phenotype network represented by a pseudo-bipartite graph, that allows formulate a topological definition of the concepts of robustness and evolvability.
 We further study the problem of evolutionary escape for cell populations with genotype-phenotype map, based on a multi-type branching process. We present a comparative analysis between genotype-phenotype networks obtained from the multi-scale model and networks constructed assuming that the genotype space is a regular hypercube. We compare the effects on the probability of escape and the escape rate associated to the evolutionary dynamics between both classes of graphs. 
 We further the study of evolutionary escape by analysing the long term survival conditioned to escape. Traditional approaches to the study of escape assume that the reproduction number of the escape genotype approaches infinity, and, therefore, survival is a surrogate of escape. Here, we analyse the process of survival upon escape by taking advantage of the fact that the natural setting of the escape problem endows the system with a separation of time scales: an initial, fast-decaying regime where escape actually occurs, is followed by a much slower dynamics within the (neutral network of) the escape phenotype. The probability of survival is analysed in terms of topological features of the neutral network of the escape phenotype. En aquesta tesi es desenvolupa un model multi-escala de la dinàmica evolutiva d'una població de cèl·lules, tenint en compte la correspondència entre el genotip i el fenotip determinat per un model de la xarxa de regulació genètica. Estudiem les propietats topològiques de les xarxes genotip-fenotip obtingudes a partir del model multi-escala. D'altra banda, s'estudia el problema de la fugida evolutiva i la supervivència, tenint en compte una aplicació entre genotip i fenotip. Una característica destacable de les poblacions amb aplicació genotip-fenotip és que les pressions selectives actuen sobre els fenotips, en lloc dels genotips. El nostre model multi-escala genera l'evolució d'una xarxa genotip-fenotip representada per un graf pseudo-bipartit, el qual permet formular una definició topològica dels conceptes de robustesa y capacitat evolutiva. A més a més, estudiem el problema de fugida evolutiva de poblacions de cèl¿lules amb una aplicació genotip-fenotip, basat en en un procés de ramificació multi-tipus. Presentem un anàlisi comparatiu entre les xarxes de genotip-fenotip obtingudes a partir del model multi-escala i les xarxes construïdes assumint un espai de genotips de tipus hipercub regular. Comparem els efectes de la probabilitat de fugida i la freqüència d'escapament associades a la dinàmica evolutiva entre ambdues classes de grafs. Anem més enllà de l'estudi de fugida evolutiva mitjançant l'anàlisi de la supervivència a llarg plaç condicionat a fugir. Els enfocaments tradicionals per a l'estudi de la fugida o escapament suposen una taxa de reproducció en el genotip de fugida propera a infinit. Per tant, la supervivència és equivalent a la fugida. Aquí analitzem el procés de supervivència suposant fugida aprofitant el fet que l'entorn natural del problema de fugida dota al sistema amb una separació d'escales de temps: un règim inicial, de temps ràpid, on la fugida realment es produeix; seguit d'una dinàmica molt més lenta dins de la (xarxa neutra del) fenotip de fugida. La probabilitat de supervivència s'analitza en termes de les característiques topològiques de la xarxa neutra del fenotip de fugida" @default.
- W847044513 created "2016-06-24" @default.
- W847044513 creator A5048925403 @default.
- W847044513 date "2023-10-07" @default.
- W847044513 modified "2023-10-18" @default.
- W847044513 title "Evolutionary dynamics of populations with genotype-phenotype map" @default.
- W847044513 cites W1487920553 @default.
- W847044513 cites W1493831303 @default.
- W847044513 cites W1554180547 @default.
- W847044513 cites W1556758605 @default.
- W847044513 cites W1578099820 @default.
- W847044513 cites W1603996780 @default.
- W847044513 cites W1669331355 @default.
- W847044513 cites W1865525050 @default.
- W847044513 cites W1875112053 @default.
- W847044513 cites W1965212834 @default.
- W847044513 cites W1965857389 @default.
- W847044513 cites W1968763100 @default.
- W847044513 cites W1976625337 @default.
- W847044513 cites W1977940795 @default.
- W847044513 cites W1978825280 @default.
- W847044513 cites W1982583288 @default.
- W847044513 cites W1986122165 @default.
- W847044513 cites W1989921625 @default.
- W847044513 cites W1992021819 @default.
- W847044513 cites W1992611645 @default.
- W847044513 cites W1995996823 @default.
- W847044513 cites W1997698259 @default.
- W847044513 cites W2004778468 @default.
- W847044513 cites W2008878539 @default.
- W847044513 cites W2011420188 @default.
- W847044513 cites W2012276721 @default.
- W847044513 cites W2013487313 @default.
- W847044513 cites W2015792064 @default.
- W847044513 cites W2023690349 @default.
- W847044513 cites W2032332507 @default.
- W847044513 cites W2032516423 @default.
- W847044513 cites W2035654977 @default.
- W847044513 cites W2042693705 @default.
- W847044513 cites W2043971857 @default.
- W847044513 cites W2044881936 @default.
- W847044513 cites W2044988896 @default.
- W847044513 cites W2045825103 @default.
- W847044513 cites W2047693963 @default.
- W847044513 cites W2048438929 @default.
- W847044513 cites W2052104835 @default.
- W847044513 cites W2057659038 @default.
- W847044513 cites W2059557910 @default.
- W847044513 cites W2059867930 @default.
- W847044513 cites W2060915805 @default.
- W847044513 cites W2073531001 @default.
- W847044513 cites W2074843929 @default.
- W847044513 cites W2076977679 @default.
- W847044513 cites W2078364967 @default.
- W847044513 cites W2079052324 @default.
- W847044513 cites W2080540350 @default.
- W847044513 cites W2083034544 @default.
- W847044513 cites W2084516445 @default.
- W847044513 cites W2084924279 @default.
- W847044513 cites W2091476183 @default.
- W847044513 cites W2102216585 @default.
- W847044513 cites W2104989261 @default.
- W847044513 cites W2105291362 @default.
- W847044513 cites W2106391833 @default.
- W847044513 cites W2112090702 @default.
- W847044513 cites W2112609377 @default.
- W847044513 cites W2118015073 @default.
- W847044513 cites W2124015221 @default.
- W847044513 cites W2129905273 @default.
- W847044513 cites W2129918926 @default.
- W847044513 cites W2131706188 @default.
- W847044513 cites W2137266088 @default.
- W847044513 cites W2140361415 @default.
- W847044513 cites W2148323109 @default.
- W847044513 cites W2167031279 @default.
- W847044513 cites W2169015768 @default.
- W847044513 cites W2170766502 @default.
- W847044513 cites W2171463101 @default.
- W847044513 cites W2314143613 @default.
- W847044513 cites W234963275 @default.
- W847044513 cites W2556090403 @default.
- W847044513 cites W2951665412 @default.
- W847044513 cites W2983896310 @default.
- W847044513 cites W305360974 @default.
- W847044513 cites W3113109455 @default.
- W847044513 cites W3143219376 @default.
- W847044513 cites W41049822 @default.
- W847044513 doi "https://doi.org/10.5821/dissertation-2117-95567" @default.
- W847044513 hasPublicationYear "2023" @default.
- W847044513 type Work @default.
- W847044513 sameAs 847044513 @default.
- W847044513 citedByCount "0" @default.
- W847044513 crossrefType "dissertation" @default.
- W847044513 hasAuthorship W847044513A5048925403 @default.
- W847044513 hasBestOaLocation W8470445131 @default.
- W847044513 hasConcept C104317684 @default.
- W847044513 hasConcept C127716648 @default.
- W847044513 hasConcept C135763542 @default.
- W847044513 hasConcept C144024400 @default.
- W847044513 hasConcept C149923435 @default.